RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 WRNIP1Q96S55 665 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 CSRNP1Q96S65 589 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 CSADQ9Y600 493 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 DOCK1Q14185 1865 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 SIPA1L1O43166 1804 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 SPRYD7Q5W111 196 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 GCC1Q96CN9 775 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 HAUS7Q99871 368 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 CA12O43570 354 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 PPP4CP60510 307 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K9P80192 1104 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 VGLL4Q14135 290 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 WNK4Q96J92 1243 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 ELP3Q9H9T3 547 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 CERS3Q8IU89 383 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 SREBF2Q12772 1141 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 PDE6AP16499 860 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 OPTNQ96CV9 577 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.637e-9■■■■□ 20.6
NELFE-208ENST00000481121 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 TSKSQ9UJT2 592 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 FLT1P17948 1338 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 LBX1P52954 281 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-208ENST00000481121 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 INPP5BP32019 993 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 GJA5P36382 358 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 OTUD5Q96G74 571 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 TM4SF4P48230 202 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 RNF186Q9NXI6 227 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 ERC2O15083 957 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 MX1P20591 662 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 ADD2P35612 726 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 USP5P45974 858 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 TRPA1O75762 1119 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 ERO1BQ86YB8 467 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 PTPRFP10586 1907 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 MYH8P13535 1937 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 INHBEP58166 350 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K10Q02779 954 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 SMC5Q8IY18 1101 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 SLURP2P0DP57 97 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 FAM196BA6NMK8 535 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D12O60347 775 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 IGHDP01880 384 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.14■■□□□ 1.62
NELFE-208ENST00000481121 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
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