RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RBM39-231	ENST00000477334	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RBM39-231	ENST00000477334	MED26	O95402	600 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	TIAF1	O95411	115 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	LIG1	P18858	919 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	LMNB1	P20700	586 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC14	Q15048	493 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF394	Q53GI3	561 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	GRIK1	P39086	918 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM74	Q96NL1	305 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	RAD18	Q9NS91	495 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	PRR19	A6NJB7	356 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF862	O60290	1169 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	PF4	P02776	101 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	PWP1	Q13610	501 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	SEPT6	Q14141	434 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	SGO2	Q562F6	1265 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	USP48	Q86UV5	1035 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM37	O94972	964 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	RHOV	Q96L33	236 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	WDR18	Q9BV38	432 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	KRT82	Q9NSB4	513 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	AOC2	O75106	756 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	DRD2	P14416	443 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	SPINK2	P20155	84 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	RXRB	P28702	533 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	LMNB2	Q03252	620 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	DTX1	Q86Y01	620 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM39-231	ENST00000477334	WDR64	B1ANS9	1081 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	SLFN14	P0C7P3	912 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	F13A1	P00488	732 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	ADH5	P11766	374 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	CDK8	P49336	464 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	USP11	P51784	963 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	INPP5A	Q14642	412 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	MCTP1	Q6DN14	999 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	CSAD	Q9Y600	493 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	TMPRSS2	O15393	492 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	GART	P22102	1010 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	6.94	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	PAOX	Q6QHF9	649 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	DYM	Q7RTS9	669 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RBM39-231	ENST00000477334	C12orf40	Q86WS4	652 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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