RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX13Q9UN79 622 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 HTR3BO95264 441 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX5P35711 763 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 EID1Q9Y6B2 187 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PRC1O43663 620 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCY3O60266 1144 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 SUSD5O60279 629 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPRAP18433 802 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 MLECQ14165 292 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PCSK7Q16549 785 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PDZD3Q86UT5 571 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 MORC4Q8TE76 937 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 EPN3Q9H201 632 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 MCM8Q9UJA3 840 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 ALG1L2C9J202 215 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 H7C1W4 665 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PDE8AO60658 829 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 AP3B2Q13367 1082 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PERM1Q5SV97 790 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf48Q96LL4 319 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFLR1Q9H665 355 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 GMIPQ9P107 970 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A087X0B3 334 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0G2JS52 829 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 RFPL3O75679 317 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 PMLP29590 882 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 CDK8P49336 464 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGGTB-209ENST00000473406 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP42Q96MM3 310 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
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RABGGTB-209ENST00000473406 FAM182BQ5T319 152 aa8.13□□□□□ -1.11
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RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM177BA6PVY3 158 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 GFRA2O00451 464 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 ACRP10323 421 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 SELPP16109 830 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 IKBKEQ14164 716 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 DBN1Q16643 649 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-209ENST00000473406 RNF180Q86T96 592 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 UBR7Q8N806 425 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 PMM1Q92871 262 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-209ENST00000473406 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 MAN1A2O60476 641 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDH1L1O75891 902 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 CPB1P15086 417 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 FGFR3P22607 806 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.11□□□□□ -1.11
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