RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 PDE6AP16499 860 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 MAP3K9P80192 1104 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 CSRNP1Q96S65 589 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 DOCK2Q92608 1830 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 SMC5Q8IY18 1101 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 WRNIP1Q96S55 665 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 FOXN1O15353 648 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 SPRYD7Q5W111 196 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 ELP3Q9H9T3 547 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 CSADQ9Y600 493 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 MX1P20591 662 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 VGLL4Q14135 290 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 CERS3Q8IU89 383 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 WNK4Q96J92 1243 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 ERC2O15083 957 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 ADD2P35612 726 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 FLT1P17948 1338 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 OPTNQ96CV9 577 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 LNPKQ9C0E8 428 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 PCNTO95613 3336 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 SLURP2P0DP57 97 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 INPP5BP32019 993 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 GJA5P36382 358 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 USP5P45974 858 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 OTOFQ9HC10 1997 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 CA12O43570 354 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 CHGBP05060 677 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 MAP3K10Q02779 954 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 NUCB1Q02818 461 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 SREBF2Q12772 1141 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 UBE3CQ15386 1083 aa21.79■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 AK9Q5TCS8 1911 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D12O60347 775 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 LCORLQ8N3X6 602 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 OTUD5Q96G74 571 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 STAP2Q9UGK3 403 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 TSKSQ9UJT2 592 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 FAM196BA6NMK8 535 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 TM4SF4P48230 202 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 PDE1AP54750 535 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 ERO1BQ86YB8 467 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 ARMT1Q9H993 441 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 RNF186Q9NXI6 227 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 PALD1Q9ULE6 856 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-205ENST00000426683 MBD4O95243 580 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 LBX1P52954 281 aa21.76■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 TRPA1O75762 1119 aa21.75■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 HLA-DOAP06340 250 aa21.75■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 INHBEP58166 350 aa21.75■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.75■■□□□ 1.07
HERC3-205ENST00000426683 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.75■■□□□ 1.07
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