RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.21□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.21□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.21□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 BICDL2A1A5D9 508 aa7.21□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.21□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.21□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 OLFM3Q96PB7 478 aa7.21□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1B0GVL5 298 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 KIF9Q9HAQ2 790 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.2□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.2□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 ABCB6Q9NP58 842 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 TADA3O75528 432 aa7.2□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 ABCC5O15440 1437 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 CFAP157Q5JU67 520 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 EMBQ6PCB8 327 aa7.2□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 KRT71Q3SY84 523 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 RAB17Q9H0T7 212 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 PPP2R5EQ16537 467 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.2□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 PSMA7O14818 248 aa7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 SCRN1Q12765 414 aa7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.19□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 PARP2Q9UGN5 583 aa7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 ATP5HO75947 161 aa7.19□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 EPN3Q9H201 632 aa7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MAP3K7O43318 606 aa7.19□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 SMIM23A6NLE4 172 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MMP14P50281 582 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 CUL4AQ13619 759 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 ADALQ6DHV7 355 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 HAUS4Q9H6D7 363 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 TRPC3Q13507 836 aa7.18□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.18□□□□□ -1.26
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