RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 ELF1P32519 619 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC8AQ8IWT6 810 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 VPS52Q8N1B4 723 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 FERP16591 822 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CYP2C19P33261 490 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 PSMD7P51665 324 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF131P52739 623 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 LRMPQ12912 555 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC151A5D8V7 595 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 RNF40O75150 1001 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ADAM21Q9UKJ8 722 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 NPATQ14207 1427 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CETN1Q12798 172 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 STMN1P16949 149 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 PRC1O43663 620 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 FANCCQ00597 558 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 BICDL1Q6ZP65 573 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 BATF3Q9NR55 127 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ST5P78524 1137 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ADGRL2O95490 1459 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ABCC2Q92887 1545 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 IARSP41252 1262 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM14Q14142 442 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ATL3Q6DD88 541 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 KSR2Q6VAB6 950 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM47Q96LD4 638 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 NEK1Q96PY6 1258 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 NYXQ9GZU5 481 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 Q9H521 79 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 GRIPAP1Q4V328 841 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CALML4Q96GE6 196 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 HOXB7P09629 217 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 GNAT2P19087 354 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 NGLY1Q96IV0 654 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 CABP5Q9NP86 173 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 TBX22Q9Y458 520 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 NECAB1Q8N987 351 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 SAMM50Q9Y512 469 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRO-201ENST00000281171 ATP1A2P50993 1020 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 ATP8B2P98198 1209 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 SPAG5Q96R06 1193 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 RNF8O76064 485 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 TCP11Q8WWU5 503 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 USP26Q9BXU7 913 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 FLOT1O75955 427 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 TOM1O60784 492 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 ABCC1P33527 1531 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 PI4KAP2A4QPH2 592 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 SKIP12755 728 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 KRT13P13646 458 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 SLC30A9Q6PML9 568 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 TMTC1Q8IUR5 882 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 LINS1Q8NG48 757 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 F6X3S4 739 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 ATP2A1O14983 1001 aa16■□□□□ 0.15
PTPRO-201ENST00000281171 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 599.2 ms