RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa25.94■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myh3P13541 1940 aa25.94■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dctn1O08788 1281 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PsdQ5DTT2 1024 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Glis3Q6XP49 780 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfm5Q8BU90 496 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Frat2Q8K025 231 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem143Q8VD26 458 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dnajc25A2ALW5 357 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ces1hD3Z298 562 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GmnnO88513 206 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Grin1P35438 938 aa25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pde4bB1AWC9 736 aa25.92■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lmod3E9QA62 571 aa25.92■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Samsn1P57725 372 aa25.92■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa25.92■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp7b1Q60991 507 aa25.92■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdc27A2A6Q5 825 aa25.91■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dennd3A2RT67 1274 aa25.91■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm5624F6ZZG8 207 aa25.91■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc7a1Q09143 622 aa25.91■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Larp6Q8BN59 492 aa25.91■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ctdspl2Q8BG15 465 aa25.91■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tspyl4Q8VD63 406 aa25.91■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tubgcp2Q921G8 905 aa25.91■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pde11aP0C1Q2 933 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tnni2P13412 182 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GabrdP22933 449 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myo1bP46735 1107 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q3TYL0 343 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Terb1Q8C0V1 768 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q8K2W9 541 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mtmr6Q8VE11 617 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ginm1Q91WR6 327 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stk39Q9Z1W9 556 aa25.9■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ifit1bl2Q3U687 466 aa25.89■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clec16aQ80U30 1036 aa25.89■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf41Q8BH75 317 aa25.89■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Etnk1Q9D4V0 363 aa25.89■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc12Q8BW49 704 aa25.89■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc14Q9CSP9 761 aa25.89■■□□□ 1.74
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm10134F6ZQC6 126 aa25.88■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SsbP32067 415 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ift122Q6NWV3 1182 aa25.88■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Efcc1Q9JJF6 558 aa25.88■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr119Q7TRJ5 321 aa25.88■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa25.88■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Miga2Q8BK03 593 aa25.88■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp24a1Q64441 514 aa25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Klhl30Q8C3F7 581 aa25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Krt23Q99PS0 422 aa25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myo3bQ1EG27 1305 aa25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Paxbp1P58501 919 aa25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf496Q5SXI5 585 aa25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zscan20B2KFW1 1030 aa25.86■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cep89Q9CZX2 791 aa25.86■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tubb4aQ9D6F9 444 aa25.86■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Scn11aQ9R053 1765 aa25.86■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc27a1Q60714 646 aa25.86■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Krt39Q6IFX4 482 aa25.86■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tgs1Q923W1 853 aa25.86■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tfcp2Q9ERA0 502 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Acad12D3Z7X0 555 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 1700029H14RikE9PY36 240 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Diaph1O08808 1255 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Otop3Q80UF9 577 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Asnsd1Q8BFS9 627 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc39a11Q8BWY7 342 aa25.85■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PnnO35691 725 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Siah1aP61092 282 aa25.84■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pex1Q5BL07 1284 aa25.84■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prl7d1P04769 244 aa25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc7a3P70423 618 aa25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam89aQ14BJ1 175 aa25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4930548H24RikQ9D496 437 aa25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vps16Q920Q4 839 aa25.83■■□□□ 1.73
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abcb6Q9DC29 842 aa25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.9 ms