RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 PRO0255Q9UI72 69 aa15.55■□□□□ 0.08
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PTPRJ-208ENST00000615445 HIGD1BQ9P298 99 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMB8P28062 276 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-208ENST00000615445 Q6ZS46 218 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA12Q7Z6I5 190 aa15.54■□□□□ 0.08
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PTPRJ-208ENST00000615445 CLEC2BQ92478 149 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-208ENST00000615445 PCNTO95613 3336 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRJ-208ENST00000615445 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.31■□□□□ 0.04
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PTPRJ-208ENST00000615445 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRJ-208ENST00000615445 REG3AQ06141 175 aa15.3■□□□□ 0.04
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