RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613049.4

RGS3-231, Transcript of regulator of G protein signaling 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RGS3, Length 1,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGS3-231	ENST00000613049		Q9UF83	564 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	DLEU1	O43261	78 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	FGF6	P10767	208 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	NMU	P48645	174 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	COTL1	Q14019	142 aa		13.33	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		13.33	□□□□□ -0.27
RGS3-231	ENST00000613049	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	TCTA	P57738	103 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	CST9L	Q9H4G1	147 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	BATF	Q16520	125 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049		X6R8D5	127 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	NPS	P0C0P6	89 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	SIVA1	O15304	175 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	EMP1	P54849	157 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	PCP2	Q8IVA1	136 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	CRYBA4	P53673	196 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	UBE2D3	P61077	147 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	UBE2D2	P62837	147 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	VCX2	Q9H322	139 aa		13.27	□□□□□ -0.28
RGS3-231	ENST00000613049	DEFB135	Q30KP9	77 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	C11orf86	A6NJI1	115 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	GAGE1	Q13065	139 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	GAGE4	Q13068	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	GAGE5	Q13069	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	MPV17L2	Q567V2	206 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049		A0A1B0GV90	55 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	FHL2	Q14192	279 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049		E9PLD3	99 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	DEFB130B	P0DP73	79 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	DEFB130A	P0DP74	79 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	HERVK_113	P61574	105 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	OR11H2	Q8NH07	326 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	AMELX	Q99217	191 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	HIGD1B	Q9P298	99 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	FAM104A	Q969W3	186 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RGS3-231	ENST00000613049	MIF	P14174	115 aa		13.21	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.21	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	HSD52	Q0P140	79 aa		13.21	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.21	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	RNF183	Q96D59	192 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	ANK2	Q01484	3957 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049		Q6ZUT4	128 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RGS3-231	ENST00000613049	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		13.18	□□□□□ -0.3

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