RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01600	Q96MT4	127 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SULT1A2	P50226	295 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	C7orf33	Q8WU49	177 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	C11orf52	Q96A22	123 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	UMAD1	C9J7I0	102 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	AMT	P48728	403 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL20	P78556	96 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	MAJIN	Q3KP22	176 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR73	Q6P4I2	378 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	NIT2	Q9NQR4	276 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A096LNI7	61 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2L6	O14933	153 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNG7	P62955	275 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	COTL1	Q14019	142 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF345	Q14585	488 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	STPG4	Q8N801	248 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	GTSF1	Q8WW33	167 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB19	A4D1S5	217 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	GNG13	Q9P2W3	67 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LPA	P08519	4548 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0J9YXV3	536 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TRGC1	P0CF51	173 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	NTF3	P20783	257 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CTRL	P40313	264 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	AKAP14	Q86UN6	197 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338		F2Z2F3	143 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL2L11	O43521	198 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP10-8	P60410	259 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXI1	Q12951	378 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CFAP161	Q6P656	301 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	GATD1	Q8NB37	220 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	IFNA1	P01562	189 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	GNG4	P50150	75 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM12	Q96EX1	92 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CNFN	Q9BYD5	112 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	XKRY2	A2RUG3	117 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	HMSD	A8MTL9	139 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF6	P10767	208 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-233	ENST00000602338	APCS	P02743	223 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	XCL1	P47992	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	TWIST1	Q15672	202 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM231B	A6NCW3	169 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NCR2	O95944	276 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	IFITM2	Q01629	132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	REG3G	Q6UW15	175 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	CARD19	Q96LW7	228 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338		H7C423	109 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338		K7EN84	100 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL25	O15444	150 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE6D	O43924	150 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	MED9	Q9NWA0	146 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	GAS8-AS1	O95177	125 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL2	P10415	239 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZRP5	223 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	TSHB	P01222	138 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	BIN3	Q9NQY0	253 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ESD	P10768	282 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	PTTG1IP	P53801	180 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SYCN	Q0VAF6	134 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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