RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 KNCNA6PVL3 124 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 ODF3Q96PU9 254 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 H7C2G1 150 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 Q8N1Y9 231 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 ZNF843Q8N446 348 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 A0A096LNT2 108 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 Q96MF0 132 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 HIVEP2P31629 2446 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 HERVK_113P63121 156 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 TMEM101Q96IK0 257 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 UBE2D3P61077 147 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 UBE2D2P62837 147 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 ZNF56Q15929 161 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 CR1P17927 2039 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 Q6Q795 121 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 J3QLI3 93 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A16P16260 332 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.15□□□□□ -0.62
CTIF-205ENST00000587860 H3BUA1 57 aa11.15□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 PROK1P58294 105 aa11.15□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 ZNF702PQ9H963 129 aa11.15□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 Q9UF83 564 aa11.15□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 J3KT08 172 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 P0DMU3 169 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 FAM231AP0DMU4 169 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 FAM231CP0DMU5 169 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.14□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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CTIF-205ENST00000587860 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.13□□□□□ -0.63
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CTIF-205ENST00000587860 KLLNB2CW77 178 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 NDUFA7O95182 113 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 DEFB131AP59861 70 aa11.13□□□□□ -0.63
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CTIF-205ENST00000587860 BAALCQ8WXS3 180 aa11.13□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 PEMTQ9UBM1 199 aa11.13□□□□□ -0.63
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CTIF-205ENST00000587860 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.12□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 LINC00315P59091 139 aa11.12□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.12□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.12□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 A0A0J9YX75 114 aa11.12□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 ZNF815PA8K554 130 aa11.12□□□□□ -0.63
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CTIF-205ENST00000587860 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.12□□□□□ -0.63
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CTIF-205ENST00000587860 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.1□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.1□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.1□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 PMVKQ15126 192 aa11.1□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 LINC01546A6NGU7 62 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 K7EMT4 169 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 DSCR9P59020 149 aa11.09□□□□□ -0.63
CTIF-205ENST00000587860 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.09□□□□□ -0.63
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