RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 F8W1H4 67 aa6.36□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 GAS8-AS1O95177 125 aa6.36□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.36□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.36□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 H3BUT2 72 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 RHODO00212 210 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF56Q15929 161 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 F5H697 171 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 DEFB135Q30KP9 77 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 C20orf78Q9BR46 151 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 X6R8D5 127 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 RS1O15537 224 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 SMIM13P0DJ93 91 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 CKS1BP61024 79 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 Q6ZTI0 123 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC01546A6NGU7 62 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 H7C1H1 209 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 M0QY20 66 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 HIGD1BQ9P298 99 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 FGF6P10767 208 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 Q8N8P6 123 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 RNF183Q96D59 192 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.33□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR11H2Q8NH07 326 aa6.32□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 K7EMI3 77 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGHV3-53P01767 116 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 MIFP14174 115 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 EMP1P54849 157 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.31□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 NACAE9PAV3 2078 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 LYRM9A8MSI8 78 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 GAGE7O76087 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 HBDP02042 147 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 GAGE12FP0CL80 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 GAGE12GP0CL81 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 GAGE12IP0CL82 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 Q8NAQ8 132 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 C18orf15Q96N68 181 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 A0A096LNJ9 63 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 VCYO14598 125 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 LAGE3Q14657 143 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 TAL2Q16559 108 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 USP17L23D6RBM5 183 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 CRYBA4P53673 196 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 Q6ZSN1 163 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 KIR2DL4Q99706 377 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 NOTCH1P46531 2555 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 K7EQD1 137 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-211ENST00000586397 P0DMU3 169 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.1 ms