RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-209ENST00000580646 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-209ENST00000580646 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-209ENST00000580646 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-209ENST00000580646 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-209ENST00000580646 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-209ENST00000580646 BORCS7Q96B45 105 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-209ENST00000580646 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-209ENST00000580646 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 M0R381 172 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 SERF1AO75920 110 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 TSPAN13O95857 204 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 NUDT3O95989 172 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-53P01767 116 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 TSKUQ8WUA8 353 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 PAX4O43316 350 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 CRYGDP07320 174 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 Q8N976 141 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 GTSF1Q8WW33 167 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 V9GYV3 84 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 K7EP34 96 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 HSD52Q0P140 79 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 RHOHQ15669 191 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 A0A096LPF7 62 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 A0A0J9YY99 117 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 M0R2N4 97 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 AMTP48728 403 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 ODF1Q14990 250 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 JPT2Q9H910 190 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 DNAH2Q9P225 4427 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 HIGD1CA8MV81 97 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 K7EQD1 137 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 NTF3P20783 257 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 TPPP3Q9BW30 176 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 A0A087WWL8 130 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 A0A1B0GUT8 65 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 H3BRM9 83 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 GYPEP15421 78 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 SRIP30626 198 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 CCL18P55774 89 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 LINC00315P59091 139 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-209ENST00000580646 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 C9orf118A6NHY6 69 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 NUPR1O60356 82 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 C3orf79P0CE67 100 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 LINC00694P0DN24 101 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 TIRAPP58753 221 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 TWIST1Q15672 202 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 Q6ZR54 194 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 Q6ZSN1 163 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 NUP35Q8NFH5 326 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 UPK3BQ9BT76 320 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 A0A1B0GW15 77 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 H7C1H1 209 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 RTL8CO15255 209 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 EVI2AP22794 236 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 ZNF56Q15929 161 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 MPV17L2Q567V2 206 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 HLA-DQA1P01909 254 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 LINC00310P59036 64 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-209ENST00000580646 GAGE5Q13069 117 aa6.81□□□□□ -1.32
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