RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 LINC00694P0DN24 101 aa12.01□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 NTF3P20783 257 aa12.01□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.01□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 GAGE12JA6NER3 117 aa12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 HBBP68871 147 aa12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 GAGE1Q13065 139 aa12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 GAGE4Q13068 117 aa12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 GAGE5Q13069 117 aa12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 TWIST1Q15672 202 aa12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 GAGE13Q4V321 117 aa12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 RASL11AQ6T310 242 aa12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 CBLN2Q8IUK8 224 aa12□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 RHODO00212 210 aa11.99□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 LECT2O14960 151 aa11.99□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 OXTP01178 125 aa11.99□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.99□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 GATD1Q8NB37 220 aa11.99□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 YPEL4Q96NS1 127 aa11.99□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 TM2D2Q9BX73 214 aa11.99□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 JPT2Q9H910 190 aa11.99□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 Q9UF83 564 aa11.99□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.98□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 ELOBQ15370 118 aa11.98□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.98□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 SAMD10Q9BYL1 202 aa11.98□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.97□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.97□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.96□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 SMIM17P0DL12 118 aa11.96□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 SSTP61278 116 aa11.96□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 COX19Q49B96 90 aa11.96□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
INO80E-212ENST00000568043 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.95□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.94□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 SCO1O75880 301 aa11.94□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 CAMPP49913 170 aa11.94□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.94□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 A0A087WWL8 130 aa11.93□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.93□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.93□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 HLA-DQA1P01909 254 aa11.92□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 MT-ND6P03923 174 aa11.92□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 BAALCQ8WXS3 180 aa11.92□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 MGPP08493 103 aa11.91□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 RAB4BP61018 213 aa11.91□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 ZNF56Q15929 161 aa11.91□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.91□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.91□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.91□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 NIT1Q86X76 327 aa11.9□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 AMN1Q8IY45 258 aa11.9□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 COX11Q9Y6N1 276 aa11.9□□□□□ -0.5
INO80E-212ENST00000568043 MRAP2Q96G30 205 aa11.89□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 RNF185Q96GF1 192 aa11.89□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.89□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 COLCA2A8K830 154 aa11.88□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 RAB4AP20338 218 aa11.88□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.88□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 RMI2Q96E14 147 aa11.88□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 F5H697 171 aa11.87□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 H7C1H1 209 aa11.87□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 KLK12Q9UKR0 248 aa11.87□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.86□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.86□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 A0A087WX48 190 aa11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 PPBPP02775 128 aa11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 MT1HL1P0DM35 61 aa11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 UBE2D3P61077 147 aa11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 UBE2D2P62837 147 aa11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 Q8N976 141 aa11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 UBE2WQ96B02 151 aa11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.85□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.84□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 M0QY20 66 aa11.84□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 APCSP02743 223 aa11.84□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 RAB5AP20339 215 aa11.84□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.84□□□□□ -0.51
INO80E-212ENST00000568043 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.83□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 D6R8Y8 96 aa11.82□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 PPP1R17O96001 155 aa11.82□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 LRP2P98164 4655 aa11.82□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 ORMDL3Q8N138 153 aa11.82□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.82□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 TNXBP22105 4242 aa11.81□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 PHOX2AO14813 284 aa11.81□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 NCR2O95944 276 aa11.81□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 CKS2P33552 79 aa11.81□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.81□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.8□□□□□ -0.52
INO80E-212ENST00000568043 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.4 ms