RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 CAMPP49913 170 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 SSTP61278 116 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 MLST8Q9BVC4 326 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 NUDT15Q9NV35 164 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 CCL25O15444 150 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 APOMO95445 188 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 CXCL1P09341 107 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 CRYGAP11844 174 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 S100A5P33763 92 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 A6NHS1 94 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 CXorf1O96002 111 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 LTAP01374 205 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 IL7P13232 177 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 LYRM1O43325 122 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 SMIM17P0DL12 118 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 AP1S3Q96PC3 154 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 MGPP08493 103 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 UBE2G2P60604 165 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 COTL1Q14019 142 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 RASL11AQ6T310 242 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 ISOC2Q96AB3 205 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 FMC1Q96HJ9 113 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 FAM74A7A6NL05 159 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 Q6ZNX1 250 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 NIT2Q9NQR4 276 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 ZNF861PO60384 105 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 ATP6V0CP27449 155 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 MT1HP80294 61 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 ZNF726P1Q15940 193 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 TSKUQ8WUA8 353 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 BCL2L11O43521 198 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 MPC2O95563 127 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 NTF3P20783 257 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 H2BFSP57053 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 H7C423 109 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 UBE2G1P62253 170 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 RNF151Q2KHN1 245 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 C2orf48Q96LS8 159 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-208ENST00000547298 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 ESDP10768 282 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 IGLC6P0CF74 106 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 MBP02144 154 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 SERF2P84101 59 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 CCDC160A6NGH7 325 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 M0QXV9 152 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 NCR2O95944 276 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 CFC1BP0CG36 223 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 UBE2BP63146 152 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 SS18Q15532 418 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 GATD1Q8NB37 220 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 G3V3Q6 166 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 TSHBP01222 138 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 MALP21145 153 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 COX7A2LO14548 114 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 APCSP02743 223 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 AKR1C3P42330 323 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 C10orf25Q5T742 122 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.2 ms