RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SST	P61278	116 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP161	Q6P656	301 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V0C	P27449	155 aa		6.76	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	6.76	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR27	Q6MZM9	219 aa		6.76	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		6.76	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	6.76	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SERF2	P84101	59 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	FMC1	Q96HJ9	113 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	VAX2	Q9UIW0	290 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2L6	O14933	153 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP10	Q96PS8	301 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM243	Q9BU79	118 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MGP	P08493	103 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZRP5	223 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SVIP	Q8NHG7	77 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	AP1S3	Q96PC3	154 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	LPA	P08519	4548 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM231B	A6NCW3	169 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM74A7	A6NL05	159 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511		H7C1H1	209 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1C3	P42330	323 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	STOML3	Q8TAV4	291 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A096LNI7	61 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0U1RQV1	116 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GUV1	79 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CST9LP1	Q5W188	147 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf56	Q8N910	161 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	LTA	P01374	205 aa		6.7	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	TPPP3	Q9BW30	176 aa		6.7	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAI2	O43623	268 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	AMT	P48728	403 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF726P1	Q15940	193 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511		M0QY20	66 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL1	P09341	107 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5AL1	P0C617	328 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	COTL1	Q14019	142 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	S100Z	Q8WXG8	99 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC2	Q02817	5179 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	UPK1B	O75841	260 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNG7	P62955	275 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	RASL11A	Q6T310	242 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	BAGE2	Q86Y30	109 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD19	Q96LW7	228 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		6.65	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-ND6	P03923	174 aa		6.65	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	FHIT	P49789	147 aa		6.65	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		6.65	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		6.65	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		6.65	□□□□□ -1.34
SKAP2-209	ENST00000497511	PAGE4	O60829	102 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PFDN1	O60925	122 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	XCL1	P47992	114 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PCP4	P48539	62 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFA1	P59665	94 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE2B	Q13066	116 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR4	Q16378	134 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	NIT2	Q9NQR4	276 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGC1	P0CF51	173 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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