RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 Q8N3U1 123 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 SMKR1H3BMG3 65 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 PHOX2AO14813 284 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 PSCAO43653 123 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 GAS8-AS1O95177 125 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 TIRAPP58753 221 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 ZNF56Q15929 161 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 FRZBQ92765 325 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 F5H697 171 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 CIDEAO60543 219 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 NCR2O95944 276 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 TRGC2P03986 189 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 MRAP2Q96G30 205 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 D6R8Y8 96 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 M0QY20 66 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 Q9UF83 564 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 MYCBP2O75592 4640 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 CKS2P33552 79 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 WFDC2Q14508 124 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 RHOHQ15669 191 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 Q8N814 137 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 NRACQ8N912 160 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 PPBPP02775 128 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 LELP1Q5T871 98 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 ORMDL3Q8N138 153 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 PRELID3AQ96N28 172 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAME-212ENST00000485532 GAGE12JA6NER3 117 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 LECT2O14960 151 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 NPYP01303 97 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 GAGE1Q13065 139 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 GAGE4Q13068 117 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 GAGE5Q13069 117 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 GAGE13Q4V321 117 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 H7C1H1 209 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 TNFRSF6BO95407 300 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 FAM229AH3BQW9 127 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 NIT2Q9NQR4 276 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BKO60814 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R17O96001 155 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BJP06899 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 LINC00694P0DN24 101 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BOP23527 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BBP33778 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BDP58876 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BCP62807 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 IQCJQ1A5X6 159 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 LINC01620Q4KN68 170 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 C20orf78Q9BR46 151 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 ST20Q9HBF5 79 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 PRSS47A8MTI9 375 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 UBE2D3P61077 147 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 UBE2D2P62837 147 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 LAGE3Q14657 143 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PRAME-212ENST00000485532 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.4 ms