RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 M0QY20 66 aa8.84□□□□□ -0.99
CENPF-202ENST00000464322 CXCL1P09341 107 aa8.84□□□□□ -0.99
CENPF-202ENST00000464322 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
CENPF-202ENST00000464322 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CENPF-202ENST00000464322 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.84□□□□□ -0.99
CENPF-202ENST00000464322 AMTP48728 403 aa8.83□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.83□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 BAGE2Q86Y30 109 aa8.83□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.83□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 LPAP08519 4548 aa8.83□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 IFITM3Q01628 133 aa8.82□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 COTL1Q14019 142 aa8.82□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.82□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 FHITP49789 147 aa8.81□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 DEFA1P59665 94 aa8.81□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.81□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 RASL11AQ6T310 242 aa8.81□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 PAGE4O60829 102 aa8.8□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.8□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.8□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.79□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.79□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 NIT2Q9NQR4 276 aa8.79□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.78□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 GAGE2BQ13066 116 aa8.78□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.78□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.78□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 CARD19Q96LW7 228 aa8.78□□□□□ -1
CENPF-202ENST00000464322 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.77□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 A0A0U1RQV1 116 aa8.77□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 PFDN1O60925 122 aa8.77□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 CACNG7P62955 275 aa8.77□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 MLST8Q9BVC4 326 aa8.77□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 ALG5Q9Y673 324 aa8.77□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 A0A1B0GV50 99 aa8.76□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 MT-ND6P03923 174 aa8.76□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 XCL1P47992 114 aa8.76□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 Q5BKY6 102 aa8.76□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 MED28Q9H204 178 aa8.76□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.76□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.75□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 TRGC1P0CF51 173 aa8.75□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 TMUB2Q71RG4 321 aa8.75□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.75□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.74□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 SYCNQ0VAF6 134 aa8.74□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 FOXI1Q12951 378 aa8.74□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.74□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 PRR4Q16378 134 aa8.73□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 C1orf137Q5JT78 98 aa8.73□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.73□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 CCL25O15444 150 aa8.72□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 IGLC6P0CF74 106 aa8.72□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 PTTG1IPP53801 180 aa8.72□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 BTF3L4Q96K17 158 aa8.72□□□□□ -1.01
CENPF-202ENST00000464322 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.71□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 A0A1W2PNN7 141 aa8.71□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 XKRY2A2RUG3 117 aa8.71□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 F2Z2F3 143 aa8.71□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 FGF6P10767 208 aa8.71□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 NTF3P20783 257 aa8.71□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 Q6ZNX1 250 aa8.71□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 TMEM101Q96IK0 257 aa8.71□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 IFNA1P01562 189 aa8.7□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 APCSP02743 223 aa8.7□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.7□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.7□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.7□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.7□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 DIRC1Q969H9 104 aa8.7□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 ISOC2Q96AB3 205 aa8.7□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 H7C423 109 aa8.69□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 SS18Q15532 418 aa8.69□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 TWIST1Q15672 202 aa8.69□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.68□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 NCR2O95944 276 aa8.68□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 BCL2P10415 239 aa8.68□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 CAMPP49913 170 aa8.68□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 GATD1Q8NB37 220 aa8.68□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 MUC2Q02817 5179 aa8.67□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 MALP21145 153 aa8.67□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 CENPWQ5EE01 88 aa8.67□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.66□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 ARPC5O15511 151 aa8.66□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 PMCHP20382 165 aa8.66□□□□□ -1.02
CENPF-202ENST00000464322 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms