RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVFC1-1P60608 527 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 IFITM2Q01629 132 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TWIST1Q15672 202 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 MPV17L2Q567V2 206 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 ENHOQ6UWT2 76 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 ISOC2Q96AB3 205 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 VCX2Q9H322 139 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 OSTCQ9NRP0 149 aa4.64□□□□□ -1.67
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RABGEF1-206ENST00000461017 LECT2O14960 151 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TRGC1P0CF51 173 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 XGP55808 180 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE6Q13070 117 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RASL11AQ6T310 242 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N976 141 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF185Q96GF1 192 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.63□□□□□ -1.67
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RABGEF1-206ENST00000461017 A8MWL6 223 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM262E9PQX1 116 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 LAGE3Q14657 143 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N814 137 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP35Q8NFH5 326 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TSKUQ8WUA8 353 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 BAALCQ8WXS3 180 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2WQ96B02 151 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 NIT2Q9NQR4 276 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 SMKR1H3BMG3 65 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 PCP4P48539 62 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMPP49913 170 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RBX1P62877 108 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 HAMPP81172 84 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 PEA15Q15121 130 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 ADIRFQ15847 76 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCJQ1A5X6 159 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 NAT8Q9UHE5 227 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WX48 190 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM231BA6NCW3 169 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 PSCAO43653 123 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK2AP2O75956 126 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB4AP20338 218 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01620Q4KN68 170 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 AMN1Q8IY45 258 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GUT8 65 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 H7C1H1 209 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 NCR2O95944 276 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 GCSHP23434 173 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 TM2D2Q9BX73 214 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR34Q9NV39 138 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-206ENST00000461017 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.59□□□□□ -1.67
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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RABGEF1-206ENST00000461017 NRACQ8N912 160 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM243Q9BU79 118 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.57□□□□□ -1.68
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RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GXF2 115 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf52A6NGY3 159 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 TSHBP01222 138 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ESDP10768 282 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ADCYAP1P18509 176 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 AMTP48728 403 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 RIGQ13278 110 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOBQ15370 118 aa4.57□□□□□ -1.68
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