RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434373.3

BBS9-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 1 (best)

Gene BBS9, Length 1,982 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-208	ENST00000434373	UBE2D3	P61077	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	UBE2D2	P62837	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	PAX4	O43316	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	GAGE1	Q13065	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	GAGE4	Q13068	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	GAGE5	Q13069	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373		Q9UF83	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373		A0A0J9YWU9	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373		F5H768	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	NPS	P0C0P6	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	GYPE	P15421	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373		Q6ZN92	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	C12orf57	Q99622	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373		H3BNG1	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	PRSS1	P07477	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	S100A12	P80511	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	HTN3	P15516	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373		H7C423	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373		A0A0J9YY99	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373		H0Y8G0	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	UBE2L6	O14933	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373		Q6ZTC4	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BBS9-208	ENST00000434373	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	PMVK	Q15126	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373		Q8N976	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373		A0A087WX48	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	PLN	P26678	52 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373		F8VRH5	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	PKIA	P61925	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-208	ENST00000434373	DEFA6	Q01524	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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