RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.33□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.33□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 CUBNO60494 3623 aa9.33□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.32□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.32□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.32□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.32□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.32□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 CRYBA4P53673 196 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 HERVK_113P61574 105 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 BATFQ16520 125 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 CST9LQ9H4G1 147 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 X6R8D5 127 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 DNHD1Q96M86 4753 aa9.31□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 LYRM9A8MSI8 78 aa9.3□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 SIVA1O15304 175 aa9.3□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 EMP1P54849 157 aa9.3□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 VCX2Q9H322 139 aa9.3□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.29□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.29□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.29□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE12JA6NER3 117 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 FGF6P10767 208 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 TCTAP57738 103 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBE2D3P61077 147 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBE2D2P62837 147 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE1Q13065 139 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE4Q13068 117 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE5Q13069 117 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB135Q30KP9 77 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAGE13Q4V321 117 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 OR11H2Q8NH07 326 aa9.28□□□□□ -0.92
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.27□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 MIFP14174 115 aa9.27□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.27□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 C11orf86A6NJI1 115 aa9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB130BP0DP73 79 aa9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB130AP0DP74 79 aa9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 FHL2Q14192 279 aa9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 NFE4Q86UQ8 179 aa9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q9UF83 564 aa9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.26□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 E9PLD3 99 aa9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSD52Q0P140 79 aa9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCP2Q8IVA1 136 aa9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 HIGD1BQ9P298 99 aa9.25□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF183Q96D59 192 aa9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 AMELXQ99217 191 aa9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.24□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.23□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.23□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 A8MZ25 164 aa9.23□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 H7C423 109 aa9.23□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBE2L6O14933 153 aa9.23□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 MPV17L2Q567V2 206 aa9.23□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.23□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM243Q9BU79 118 aa9.23□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.22□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAD1P61803 113 aa9.22□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.22□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.22□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM101Q96IK0 257 aa9.22□□□□□ -0.93
NME1-NME2-201ENST00000376392 JMJD1CQ15652 2540 aa9.21□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.21□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GV90 55 aa9.21□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.21□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q6ZUT4 128 aa9.21□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRO0255Q9UI72 69 aa9.21□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A0J9YXV3 536 aa9.2□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.2□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.2□□□□□ -0.94
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00694P0DN24 101 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms