RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 C4orf26Q17RF5 130 aa7.58□□□□□ -1.2
CLDN1-201ENST00000295522 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.58□□□□□ -1.2
CLDN1-201ENST00000295522 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.58□□□□□ -1.2
CLDN1-201ENST00000295522 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.58□□□□□ -1.2
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CLDN1-201ENST00000295522 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CLDN1-201ENST00000295522 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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CLDN1-201ENST00000295522 NCR3O14931 201 aa7.47□□□□□ -1.21
CLDN1-201ENST00000295522 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CLDN1-201ENST00000295522 C20orf197Q8N268 126 aa7.47□□□□□ -1.21
CLDN1-201ENST00000295522 Q8N6K4 173 aa7.47□□□□□ -1.21
CLDN1-201ENST00000295522 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.46□□□□□ -1.21
CLDN1-201ENST00000295522 C2orf48Q96LS8 159 aa7.46□□□□□ -1.21
CLDN1-201ENST00000295522 U3KQE9 123 aa7.46□□□□□ -1.21
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