RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262643.7

CCNE1-201, Transcript of cyclin E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-201ENST00000262643 HBDP02042 147 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNE1-201ENST00000262643 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNE1-201ENST00000262643 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNE1-201ENST00000262643 Q6ZSN1 163 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNE1-201ENST00000262643 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNE1-201ENST00000262643 RS1O15537 224 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNE1-201ENST00000262643 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNE1-201ENST00000262643 ST20Q9HBF5 79 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNE1-201ENST00000262643 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNE1-201ENST00000262643 IGHV3-53P01767 116 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 C18orf15Q96N68 181 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 NACAE9PAV3 2078 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 LAGE3Q14657 143 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 M0R2N4 97 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 FCER1GP30273 86 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 TEX43Q6ZNM6 134 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF479Q96JC4 524 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 Q9UF83 564 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 RHODO00212 210 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 DNAH2Q9P225 4427 aa14.79□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 H0Y8G0 127 aa14.78□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 PRO1933Q9H354 126 aa14.78□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 H7C1H1 209 aa14.77□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 VCYO14598 125 aa14.77□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 CCL18P55774 89 aa14.77□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 RPL32P62910 135 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.77□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.77□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.77□□□□□ -0.04
CCNE1-201ENST00000262643 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.76□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 PKIAP61925 76 aa14.76□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 PET117Q6UWS5 81 aa14.76□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 ATOH7Q8N100 152 aa14.76□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 H3BNG1 76 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 VAMP8Q9BV40 100 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 C20orf202A1L168 122 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 K7EMI3 77 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 TSTD3H0UI37 97 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 PAX4O43316 350 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 FHL2Q14192 279 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 KIR2DL4Q99706 377 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 PRO0255Q9UI72 69 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 A0A096LPF7 62 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 CRYBA4P53673 196 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 LINC01545Q5VT33 79 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNE1-201ENST00000262643 I3L3M4 83 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 ESRGQ1W209 222 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 TOMM6Q96B49 74 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 MAJINQ3KP22 176 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 Q6ZR54 194 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 TSHBP01222 138 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 ATP5LO75964 103 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 SPATA45Q537H7 98 aa14.68□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.67□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 LINC00587B1AMM8 73 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 K7EQD1 137 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 SCGB3A1Q96QR1 104 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 PRSS1P07477 247 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 RPL39P62891 51 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 Q9H8V8 135 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNE1-201ENST00000262643 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 RTL8CO15255 209 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 CIDEAO60543 219 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 DDTP30046 118 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 GYPEP15421 78 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 G0S2P27469 103 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNE1-201ENST00000262643 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 251.5 ms