RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifna5P07349 189 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr46Q8VGJ4 318 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem51Q99LG1 249 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ucn2Q99ML8 113 aa23.41■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tenm1Q9WTS4 2731 aa23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm14403A2BFU4 402 aa23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Krt33bQ61897 404 aa23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr275Q7TS18 319 aa23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FuomQ8R2K1 153 aa23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp6v1fQ9D1K2 119 aa23.4■■□□□ 1.34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Syngr2O55101 224 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr823Q7TRH2 315 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr193Q7TS43 309 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr824Q8VFU4 315 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp958Q99LG7 467 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SNORCQ9CXL7 121 aa23.39■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Frrs1lB1AXV0 293 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hmgb3O54879 200 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MiaQ61865 130 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pomt1Q8R2R1 746 aa23.38■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm8265K7N6Y8 158 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gfi1bO70237 330 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P01915 264 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp36l1P23950 338 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gls2Q571F8 602 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam110dQ80X91 271 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Smco3Q8BQM7 225 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem218Q9CQ44 115 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc50a1Q9CXK4 221 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 9130008F23RikQ9D2Z6 181 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfand6Q9DCH6 223 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr872E9PVW2 323 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pfdn2O70591 154 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bmpr1bP36898 502 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ang6Q5GAN0 147 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr482Q8VG03 323 aa23.37■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r113G3UWI8 307 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fhl1P97447 280 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pilrb2Q2YFS1 225 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm10803Q3TZS6 135 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr639Q8VGY8 316 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cldn16Q925N4 235 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem147Q9CQG6 224 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spcs1Q9D958 161 aa23.36■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PipP02816 146 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fgf7P36363 194 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc35b1P97858 322 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr138Q7TRI7 312 aa23.35■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igkv14-130A0A0G2JF45 117 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm15140A2BEE3 237 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm12887B1AVM1 119 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21732J3QM79 361 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MsmbO08540 113 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prkar2aP12367 401 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NfyaP23708 346 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1204Q7TR10 309 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1445Q8VFW9 314 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr959Q9EQ86 311 aa23.34■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21095A0A087WR14 222 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ap2s1P62743 142 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ang2Q64438 145 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam222aQ6PGH4 453 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc35d2Q762D5 326 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tsen54Q8C2A2 525 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Phf13Q8K2W6 296 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rab11fip5Q8R361 645 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sval2Q99N75 144 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mrpl30Q9D7N6 160 aa23.33■■□□□ 1.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trav13n-4A0A0G2JG01 110 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm37797A0A1D5RLC8 261 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm2564F6Z9S8 108 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccl19O70460 108 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trpc5osQ3UHV4 110 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnase12Q5GAM8 145 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1385Q7TQT1 309 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr965Q7TRA7 312 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dppa1Q810Y7 116 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ap4m1Q9JKC7 449 aa23.33■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm6993A0A1W2P738 69 aa23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cldn34c4A2ANA3 212 aa23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifna2P01573 190 aa23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lsm4Q9QXA5 137 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P01788 123 aa23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ypel3P61237 119 aa23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Onecut2Q6XBJ3 505 aa23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1371Q7TQT7 311 aa23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bcl7bQ921K9 202 aa23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rchy1Q9CR50 261 aa23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem170aQ9D342 144 aa23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Avpi1Q9D7H4 142 aa23.31■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1279Q8VF38 313 aa23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv1-39A0A075B5V5 117 aa23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr978E9Q985 311 aa23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr187Q8VEX6 308 aa23.3■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm5890A0A140LI04 305 aa23.29■■□□□ 1.32
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arrdc5Q497K5 325 aa23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 126.9 ms