RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Npy1rQ04573 382 aa16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trpc5osQ3UHV4 110 aa16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RprmlQ3URD2 117 aa16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psg25Q497W1 475 aa16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rasl11aQ6IMB1 242 aa16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem218Q9CQ44 115 aa16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp6v1fQ9D1K2 119 aa16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gpa33Q9JKA5 319 aa16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psmb3Q9R1P1 205 aa16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sorl1O88307 2215 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 VwfQ8CIZ8 2813 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21095A0A087WR14 222 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv1-77A0A0G2JGS9 117 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Syngr2O55101 224 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PipP02816 146 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ifna5P07349 189 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf474Q6V5K9 347 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Habp2Q8K0D2 558 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf183Q8QZS5 190 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pomt1Q8R2R1 746 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf141Q99MB7 230 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc50a1Q9CXK4 221 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnd2Q9QYM5 227 aa16.8■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Akirin2B1AXD8 201 aa16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Frrs1lB1AXV0 293 aa16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tcte2E9PY37 120 aa16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hmgb3O54879 200 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NfyaP23708 346 aa16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bri3P28662 125 aa16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 COA4Q8BT51 87 aa16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcl7bQ921K9 202 aa16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 9130008F23RikQ9D2Z6 181 aa16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfand6Q9DCH6 223 aa16.79■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1293-psA0A1L1SVB5 326 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r113G3UWI8 307 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pfdn2O70591 154 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P01748 117 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ucp1P12242 307 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PmchP56942 165 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc45a2P58355 530 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ap2s1P62743 142 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1385Q7TQT1 309 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smco3Q8BQM7 225 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nhlrc1Q8BR37 401 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr639Q8VGY8 316 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem51Q99LG1 249 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp958Q99LG7 467 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem147Q9CQG6 224 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 UrahQ9CRB3 118 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ap4m1Q9JKC7 449 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arl3Q9WUL7 182 aa16.78■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv12-3A0A075B5T1 117 aa16.77■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm12887B1AVM1 119 aa16.77■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prkar2aP12367 401 aa16.77■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gls2Q571F8 602 aa16.77■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1204Q7TR10 309 aa16.77■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr138Q7TRI7 312 aa16.77■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr433Q7TRV9 314 aa16.77■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr193Q7TS43 309 aa16.77■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr482Q8VG03 323 aa16.77■□□□□ 0.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv5-16A0A0B4J1P4 117 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r194J3JS27 296 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd81P35762 236 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgf7P36363 194 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MiaQ61865 130 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr823Q7TRH2 315 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr275Q7TS18 319 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2-M10.6Q85ZW5 330 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr824Q8VFU4 315 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sval2Q99N75 144 aa16.76■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ifna2P01573 190 aa16.75■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P01915 264 aa16.75■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm10803Q3TZS6 135 aa16.75■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Guk1Q64520 198 aa16.75■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rab11fip5Q8R361 645 aa16.75■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nat8Q9JIY7 227 aa16.75■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr872E9PVW2 323 aa16.74■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rgs16P97428 201 aa16.74■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr187Q8VEX6 308 aa16.74■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1279Q8VF38 313 aa16.74■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cldn16Q925N4 235 aa16.74■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ucn2Q99ML8 113 aa16.74■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SNORCQ9CXL7 121 aa16.74■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrpl30Q9D7N6 160 aa16.74■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv14-130A0A0G2JF45 117 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm37797A0A1D5RLC8 261 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6993A0A1W2P738 69 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm15140A2BEE3 237 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gata3P23772 443 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ang6Q5GAN0 147 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1168Q7TR25 312 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr965Q7TRA7 312 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spcs1Q9D958 161 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr959Q9EQ86 311 aa16.73■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bmpr1bP36898 502 aa16.72■□□□□ 0.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pilrb2Q2YFS1 225 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.5 ms