Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL7

Arl3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl3Q9WUL7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Arl3Q9WUL7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arl3Q9WUL7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arl3Q9WUL7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arl3Q9WUL7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arl3Q9WUL7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arl3Q9WUL7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Arl3Q9WUL7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Arl3Q9WUL7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arl3Q9WUL7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Arl3Q9WUL7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arl3Q9WUL7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl3Q9WUL7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Arl3Q9WUL7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arl3Q9WUL7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arl3Q9WUL7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arl3Q9WUL7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arl3Q9WUL7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Arl3Q9WUL7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arl3Q9WUL7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arl3Q9WUL7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arl3Q9WUL7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arl3Q9WUL7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arl3Q9WUL7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arl3Q9WUL7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl3Q9WUL7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arl3Q9WUL7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arl3Q9WUL7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl3Q9WUL7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Arl3Q9WUL7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arl3Q9WUL7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arl3Q9WUL7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arl3Q9WUL7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arl3Q9WUL7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl3Q9WUL7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl3Q9WUL7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Arl3Q9WUL7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl3Q9WUL7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl3Q9WUL7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arl3Q9WUL7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arl3Q9WUL7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arl3Q9WUL7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arl3Q9WUL7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arl3Q9WUL7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arl3Q9WUL7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arl3Q9WUL7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arl3Q9WUL7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arl3Q9WUL7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arl3Q9WUL7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl3Q9WUL7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl3Q9WUL7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arl3Q9WUL7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl3Q9WUL7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl3Q9WUL7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl3Q9WUL7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl3Q9WUL7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arl3Q9WUL7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arl3Q9WUL7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arl3Q9WUL7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arl3Q9WUL7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl3Q9WUL7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl3Q9WUL7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl3Q9WUL7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arl3Q9WUL7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arl3Q9WUL7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arl3Q9WUL7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arl3Q9WUL7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl3Q9WUL7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl3Q9WUL7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arl3Q9WUL7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl3Q9WUL7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl3Q9WUL7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl3Q9WUL7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl3Q9WUL7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl3Q9WUL7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl3Q9WUL7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl3Q9WUL7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl3Q9WUL7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl3Q9WUL7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl3Q9WUL7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl3Q9WUL7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl3Q9WUL7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl3Q9WUL7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arl3Q9WUL7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arl3Q9WUL7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arl3Q9WUL7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl3Q9WUL7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl3Q9WUL7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl3Q9WUL7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl3Q9WUL7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl3Q9WUL7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arl3Q9WUL7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl3Q9WUL7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl3Q9WUL7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl3Q9WUL7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl3Q9WUL7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl3Q9WUL7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl3Q9WUL7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl3Q9WUL7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl3Q9WUL7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms