Protein–RNA interactions for Protein: Q497W1

Psg25, Pregnancy-specific glycoprotein 25, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg25Q497W1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Psg25Q497W1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Psg25Q497W1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psg25Q497W1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psg25Q497W1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psg25Q497W1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Psg25Q497W1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Psg25Q497W1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Psg25Q497W1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psg25Q497W1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psg25Q497W1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Psg25Q497W1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Psg25Q497W1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psg25Q497W1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psg25Q497W1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Psg25Q497W1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psg25Q497W1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psg25Q497W1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psg25Q497W1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Psg25Q497W1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psg25Q497W1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psg25Q497W1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psg25Q497W1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psg25Q497W1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psg25Q497W1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psg25Q497W1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psg25Q497W1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psg25Q497W1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psg25Q497W1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Psg25Q497W1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psg25Q497W1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psg25Q497W1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psg25Q497W1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psg25Q497W1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psg25Q497W1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psg25Q497W1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Psg25Q497W1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psg25Q497W1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psg25Q497W1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psg25Q497W1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psg25Q497W1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psg25Q497W1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psg25Q497W1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psg25Q497W1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psg25Q497W1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Psg25Q497W1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Psg25Q497W1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psg25Q497W1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psg25Q497W1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psg25Q497W1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psg25Q497W1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psg25Q497W1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psg25Q497W1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psg25Q497W1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psg25Q497W1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psg25Q497W1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psg25Q497W1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psg25Q497W1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psg25Q497W1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psg25Q497W1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psg25Q497W1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psg25Q497W1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Psg25Q497W1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psg25Q497W1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psg25Q497W1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psg25Q497W1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psg25Q497W1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psg25Q497W1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psg25Q497W1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psg25Q497W1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psg25Q497W1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psg25Q497W1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psg25Q497W1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psg25Q497W1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psg25Q497W1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psg25Q497W1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psg25Q497W1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psg25Q497W1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psg25Q497W1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psg25Q497W1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psg25Q497W1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psg25Q497W1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psg25Q497W1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psg25Q497W1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psg25Q497W1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psg25Q497W1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psg25Q497W1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psg25Q497W1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psg25Q497W1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psg25Q497W1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psg25Q497W1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psg25Q497W1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psg25Q497W1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psg25Q497W1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psg25Q497W1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psg25Q497W1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psg25Q497W1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psg25Q497W1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psg25Q497W1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Psg25Q497W1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 444.5 ms