RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF124	Q15973	351 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	JPT2	Q9H910	190 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	DKK2	Q9UBU2	259 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	MUC4	Q99102	2169 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501		A6NDN8	102 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	RS1	O15537	224 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV3-53	P01767	116 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	AZU1	P20160	251 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	CRYBA4	P53673	196 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	SEC11A	P67812	179 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	HSD52	Q0P140	79 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	RRN3P1	Q2M238	152 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	OR11H2	Q8NH07	326 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	BAALC	Q8WXS3	180 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	HIGD1B	Q9P298	99 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501		A0A1B0GV90	55 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	STPG4	Q8N801	248 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	COTL1	Q14019	142 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	MPV17L2	Q567V2	206 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	AGRN	O00468	2067 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	IGIP	A6NJ69	53 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	TSHB	P01222	138 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	TAL2	Q16559	108 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	IL17D	Q8TAD2	202 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	VCX2	Q9H322	139 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	CST9L	Q9H4G1	147 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	C11orf86	A6NJI1	115 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501		E9PLD3	99 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	FGF6	P10767	208 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	APOC4	P55056	127 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE1	Q13065	139 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	ZFHX3	Q15911	3703 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PNKP-231	ENST00000640501	ACAN	P16112	2415 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501		K7EQD1	137 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	CITED1	Q99966	193 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	NFE4	Q86UQ8	179 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501		A6NJY4	79 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501		H7C423	109 aa		6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PNKP-231	ENST00000640501	PTTG1IP	P53801	180 aa		6	□□□□□ -1.45

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