RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614459.4

MDM4-215, Transcript of MDM4, p53 regulator, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM4, Length 9,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM4-215	ENST00000614459		Q0VFX4	171 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	C3orf56	Q8N813	242 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	MGAM	O43451	1857 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459		B4DSR2	109 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV3-11	P01762	117 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.55	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459		H0Y9J4	135 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	PINLYP	A6NC86	204 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459		S4R3C0	116 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	MED13L	Q71F56	2210 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459		A0A0G2JRQ6	117 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	PRSS33	Q8NF86	280 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459		A0A0J9YY99	117 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	PSPN	O60542	156 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV3-1	P01715	115 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	NFE4	Q86UQ8	179 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	NPB	Q8NG41	125 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	PRM2	P04554	102 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	COL8A2	P25067	703 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	C17orf77	Q96MU5	243 aa		5.53	□□□□□ -1.52
MDM4-215	ENST00000614459	ACACA	Q13085	2346 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	WIPF1	O43516	503 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV1-16	P04430	117 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	GGN	Q86UU5	652 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	COL4A6	Q14031	1691 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	C15orf65	H3BRN8	121 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	WT1-AS	Q06250	92 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		5.52	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	EBI3	Q14213	229 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	XCL1	P47992	114 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459		Q96MF0	132 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459		A0A0J9YXV3	536 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	MDS2	Q8NDY4	140 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459		K7EMT4	169 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV1-39	P01597	117 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV1D-39	P04432	117 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.51	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	NUPR1	O60356	82 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459		Q6ZSR3	168 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	RNF223	E7ERA6	249 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	CD24	P25063	80 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459		H3BUX3	64 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	OVOL3	O00110	214 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	XCL2	Q9UBD3	114 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	NDP	Q00604	133 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	PRB1	P04280	392 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	PTPRB	P23467	1997 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459		Q8N6K4	173 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	SNURF	Q9Y675	71 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	CNFN	Q9BYD5	112 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	TFF1	P04155	84 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	DEFB130B	P0DP73	79 aa		5.48	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms