RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602591.1

HCG18-246, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

Gene HCG18, Length 1,976 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-246ENST00000602591 NUDT3O95989 172 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 Q6ZVH6 145 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 RETNQ9HD89 108 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 Q6ZWC4 215 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 SPANXCQ9NY87 97 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 X6R8D5 127 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-246ENST00000602591 A0A1B0GXF2 115 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 FAM231BA6NCW3 169 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 F2Z2F3 143 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 ASIPP42127 132 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 CAMPP49913 170 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 C9orf85Q96MD7 179 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 JPT2Q9H910 190 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 NACAE9PAV3 2078 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 GAGE12JA6NER3 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 A8MZ25 164 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 K7EP34 96 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 SERF1AO75920 110 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 GAGE7O76087 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 GAGE12FP0CL80 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 GAGE12GP0CL81 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 GAGE12IP0CL82 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 NTF3P20783 257 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 GAGE4Q13068 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 KCNS1Q96KK3 526 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 M0R381 172 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 DEFB4AO15263 64 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 OR5AL1P0C617 328 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 CNFNQ9BYD5 112 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 A0A1B0GUT8 65 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 F5H768 121 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 APOC4P55056 127 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 PMCHL1Q16048 86 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 A6NDN8 102 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 IL17DQ8TAD2 202 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 FBN3Q75N90 2809 aa8.49□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 SNURFLB1AK76 121 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 RS1O15537 224 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 Q0VG73 95 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 TWIST1Q15672 202 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 NXPH4O95158 308 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 GAS8-AS1O95177 125 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 EVI2AP22794 236 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 EMP1P54849 157 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.48□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.47□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 HBBP68871 147 aa8.47□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.47□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 ERASQ7Z444 233 aa8.47□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 BAGE3Q86Y29 109 aa8.47□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.47□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 MED14OSP0DP75 135 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 RRN3P1Q2M238 152 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 Q6ZTI0 123 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 Q8N976 141 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 AP1S3Q96PC3 154 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 ST20Q9HBF5 79 aa8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
HCG18-246ENST00000602591 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 SEC11AP67812 179 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 ZNF876PQ49A33 203 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 AMN1Q8IY45 258 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 Q8NAQ8 132 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 A0A087WWL8 130 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 LINC00315P59091 139 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 ZNF415Q09FC8 603 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 RIGQ13278 110 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 RNF185Q96GF1 192 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-246ENST00000602591 SMKR1H3BMG3 65 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.9 ms