RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 CACNG7P62955 275 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 GAGE2BQ13066 116 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 GAGE2EQ4V326 116 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 PTH2Q96A98 100 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 LINC00479Q96M42 142 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 CCDC140Q96MF4 163 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 LRP2P98164 4655 aa8.46□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 IFITM1P13164 125 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 NMUP48645 174 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 PCP2Q8IVA1 136 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 NPBQ8NG41 125 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 MDFICQ9P1T7 246 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 PRNDQ9UKY0 176 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 ACTL6BO94805 426 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TTC32Q5I0X7 151 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 RFESDQ8TAC1 157 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 LINC00473A8K010 186 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 H3BUA1 57 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TWIST1Q15672 202 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 FXYD5Q96DB9 178 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 IGKCP01834 107 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 IL4P05112 153 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 PRCDQ00LT1 54 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TM4SF20Q53R12 229 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 SPINK9Q5DT21 86 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 PDPNQ86YL7 162 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 ORMDL3Q8N138 153 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 RAB9BQ9NP90 201 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 A8MWV9 139 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 SPINT2O43291 252 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 SNCGO76070 127 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 DPM2O94777 84 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 UBE2D3P61077 147 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 UBE2D2P62837 147 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZTC4 211 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 NFE4Q86UQ8 179 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 THAP8Q8NA92 274 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 CARD19Q96LW7 228 aa8.41□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GX51 115 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 K7ERJ3 54 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 DEFB4AO15263 64 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 COX7A2P2O60397 106 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 FCGR3BO75015 233 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 FCER1GP30273 86 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP10-2P60368 255 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 FBXL15Q9H469 300 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
HCG18-241ENST00000602290 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 C15orf65H3BRN8 121 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 ZNF138P52744 262 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 OTORQ9NRC9 128 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 AGRNO00468 2067 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 TCRAP04437 139 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 HLA-DMBP28068 263 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 UBE2D1P51668 147 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 Q86TA4 180 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 NACAE9PAV3 2078 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 PGPA6NDG6 321 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 CCDC179H3BU77 68 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 UPK2O00526 184 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-241ENST00000602290 NPYP01303 97 aa8.37□□□□□ -1.07
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