RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 ELANEP08246 267 aa14.8□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 U3KQK5 164 aa14.8□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 A0A1B0GX51 115 aa14.79□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 HIVEP2P31629 2446 aa14.79□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 DSCR8Q96T75 97 aa14.79□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa14.79□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.78□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa14.78□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.78□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.78□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 IGLV2-11P01706 119 aa14.78□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.78□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 H0YGX0 51 aa14.77□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 BLCAPP62952 87 aa14.77□□□□□ -0.04
SUDS3-204ENST00000543473 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.76□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.76□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.76□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.76□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 RNF185Q96GF1 192 aa14.75□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.75□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.75□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.75□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 J3KT08 172 aa14.75□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.75□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.74□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 C5orf38Q86SI9 138 aa14.74□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.74□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 IGHV4-59P01825 116 aa14.74□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 A0A0J9YY99 117 aa14.74□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.74□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 RBM3P98179 157 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.73□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.73□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 XCL1P47992 114 aa14.73□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 MDFICQ9P1T7 246 aa14.73□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.72□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.72□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.72□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 PRORYQ9H606 182 aa14.72□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 A0A0J9YXY3 114 aa14.71□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 CRYGBP07316 175 aa14.71□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 LINC00643Q86TS7 51 aa14.71□□□□□ -0.05
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa14.71□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.7□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.7□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 F8WEM9 126 aa14.7□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 SPATA25Q9BR10 227 aa14.7□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC140Q96MF4 163 aa14.7□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.69□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 MIAQ16674 131 aa14.69□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 K7EMT4 169 aa14.69□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.69□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.69□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.69□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 ANGP03950 147 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 DEFB136Q30KP8 78 aa14.68□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 A0A096LPF7 62 aa14.68□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 TRBV12-3P01733 135 aa14.68□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 NFE4Q86UQ8 179 aa14.67□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 F5H768 121 aa14.67□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 LECT2O14960 151 aa14.67□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.67□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 INSL3P51460 131 aa14.67□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.67□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.67□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 RNF152Q8N8N0 203 aa14.66□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 COX7B2Q8TF08 81 aa14.66□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.66□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 IGF1P05019 195 aa14.66□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 DAD1P61803 113 aa14.65□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 MRAPQ8TCY5 172 aa14.65□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 IGHV3-33P01772 117 aa14.65□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.65□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 LRP4O75096 1905 aa14.65□□□□□ -0.06
SUDS3-204ENST00000543473 C19orf84I3L1E1 186 aa14.64□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa14.64□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.64□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 K7EQD1 137 aa14.64□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.64□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 ATP5G1P05496 136 aa14.64□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 A0A0J9YX75 114 aa14.64□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 SLURP1P55000 103 aa14.64□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 GPHB5Q86YW7 130 aa14.64□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 SIRPDQ9H106 197 aa14.63□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 Q9HAA7 133 aa14.63□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 GAS8-AS1O95177 125 aa14.63□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 LINC01548A6NM66 108 aa14.63□□□□□ -0.07
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM258P61165 79 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms