RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.58□□□□□ -2.5
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC37A3O60309 1634 aa-0.64□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASZ1Q86V15 1759 aa-0.65□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.65□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.65□□□□□ -2.51
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 J3QR89 54 aa-0.65□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFSF15O95150 251 aa-0.65□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COX6B1P14854 86 aa-0.65□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBLN1P23435 193 aa-0.65□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2D1P51668 147 aa-0.65□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HAMPP81172 84 aa-0.65□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNG10P50151 68 aa-0.66□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC26Q8NHZ8 85 aa-0.66□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMPXQ9UHP9 88 aa-0.66□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIGD1AQ9Y241 93 aa-0.66□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.66□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.67□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCE1O60756 84 aa-0.67□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNCGO76070 127 aa-0.67□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 G0S2P27469 103 aa-0.67□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.67□□□□□ -2.52
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