RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492766.5

RERE-215, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 3

Gene RERE, Length 367 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-215ENST00000492766 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.26□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.26□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.26□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.25□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 TMEM218A2RU14 115 aa9.25□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 H7C1H1 209 aa9.25□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.24□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.24□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.24□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.24□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 RASL11AQ6T310 242 aa9.24□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.24□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 C6orf223Q8N319 242 aa9.24□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.24□□□□□ -0.93
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RERE-215ENST00000492766 RIGQ13278 110 aa9.23□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.23□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 Q8N3U1 123 aa9.23□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 GATD1Q8NB37 220 aa9.23□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.23□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 F8W036 122 aa9.22□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 PPP1R2P9O14990 202 aa9.22□□□□□ -0.93
RERE-215ENST00000492766 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.22□□□□□ -0.93
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RERE-215ENST00000492766 SEC11CQ9BY50 192 aa9.21□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.2□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 IGHV3-30P01768 117 aa9.2□□□□□ -0.94
RERE-215ENST00000492766 IGHV3-33P01772 117 aa9.2□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.2□□□□□ -0.94
RERE-215ENST00000492766 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.2□□□□□ -0.94
RERE-215ENST00000492766 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 K7EP13 123 aa9.19□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.19□□□□□ -0.94
RERE-215ENST00000492766 NIT1Q86X76 327 aa9.19□□□□□ -0.94
RERE-215ENST00000492766 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.19□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.18□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.18□□□□□ -0.94
RERE-215ENST00000492766 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.17□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.16□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 MPV17L2Q567V2 206 aa9.15□□□□□ -0.94
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RERE-215ENST00000492766 Q9HAA7 133 aa9.14□□□□□ -0.95
RERE-215ENST00000492766 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.14□□□□□ -0.95
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RERE-215ENST00000492766 GAGE6Q13070 117 aa9.13□□□□□ -0.95
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RERE-215ENST00000492766 AMTP48728 403 aa9.12□□□□□ -0.95
RERE-215ENST00000492766 PKIAP61925 76 aa9.12□□□□□ -0.95
RERE-215ENST00000492766 RHEBQ15382 184 aa9.12□□□□□ -0.95
RERE-215ENST00000492766 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.12□□□□□ -0.95
RERE-215ENST00000492766 BTF3L4Q96K17 158 aa9.12□□□□□ -0.95
RERE-215ENST00000492766 IMMP2LQ96T52 175 aa9.12□□□□□ -0.95
RERE-215ENST00000492766 ST20Q9HBF5 79 aa9.12□□□□□ -0.95
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