RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 FAM210AQ96ND0 272 aa16.04■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa16.03■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 TRGC1P0CF51 173 aa16.03■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 NTF3P20783 257 aa16.03■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 CTRLP40313 264 aa16.03■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 CDPF1Q6NVV7 123 aa16.03■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 TM2D2Q9BX73 214 aa16.03■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 A0A087WX48 190 aa16.02■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa16.02■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 WDR73Q6P4I2 378 aa16.02■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 KCNIP4Q6PIL6 250 aa16.02■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 DNAH5Q8TE73 4624 aa16.02■□□□□ 0.16
SMKR1-201ENST00000462322 H7C1H1 209 aa16.01■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 GATCO43716 136 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.01■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 SMIM7Q9BQ49 75 aa16.01■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 LRCOL1A6NCL2 159 aa16■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 M0QY20 66 aa16■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 TWIST1Q15672 202 aa16■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 CHCHD7Q9BUK0 85 aa16■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM262E9PQX1 116 aa15.99■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 FAM231DQ6ZW35 169 aa15.99■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 KLK12Q9UKR0 248 aa15.99■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 SRP19P09132 144 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 ELOBQ15370 118 aa15.98■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM97Q5BJF2 176 aa15.98■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC30Q96LL9 226 aa15.98■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 CNFNQ9BYD5 112 aa15.98■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF727A8MUV8 499 aa15.97■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 GTSF1Q8WW33 167 aa15.97■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 CHCHD5Q9BSY4 110 aa15.97■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 A8MWL6 223 aa15.96■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 RASL11AQ6T310 242 aa15.96■□□□□ 0.15
SMKR1-201ENST00000462322 HSPG2P98160 4391 aa15.95■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 TEX261Q6UWH6 196 aa15.95■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa15.95■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 LINC01551Q86U37 167 aa15.95■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 UBE2WQ96B02 151 aa15.95■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 RMI2Q96E14 147 aa15.95■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 COX11Q9Y6N1 276 aa15.94■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 APOBP04114 4563 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 PKIAP61925 76 aa15.93■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 CT83Q5H943 113 aa15.93■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 Q8N814 137 aa15.93■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.93■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 PCLOQ9Y6V0 5065 aa15.93■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.92■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa15.92■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 MPV17L2Q567V2 206 aa15.92■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.92■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.92■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 NIT2Q9NQR4 276 aa15.92■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa15.91■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.91■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 GCSHP23434 173 aa15.9■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 KRTAP10-1P60331 282 aa15.9■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 Q0VG73 95 aa15.9■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 WFDC2Q14508 124 aa15.9■□□□□ 0.14
SMKR1-201ENST00000462322 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa15.89■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 LECT2O14960 151 aa15.89■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 GAGE6Q13070 117 aa15.89■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 IQCJQ1A5X6 159 aa15.89■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.89■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 BORCS7Q96B45 105 aa15.89■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 OSTCQ9NRP0 149 aa15.89■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 CRPP02741 224 aa15.88■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM241Q24JQ0 296 aa15.88■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.88■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 Q8N976 141 aa15.88■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 GATD1Q8NB37 220 aa15.88■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 TSKUQ8WUA8 353 aa15.88■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 BAALCQ8WXS3 180 aa15.88■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15.87■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 PEA15Q15121 130 aa15.87■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 C9JQL5 133 aa15.86■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 RBX1P62877 108 aa15.86■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 ENHOQ6UWT2 76 aa15.86■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 FRZBQ92765 325 aa15.86■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa15.86■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.86■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 HIGD1CA8MV81 97 aa15.85■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf43Q9BWL3 253 aa15.85■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa15.84■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 ISOC2Q96AB3 205 aa15.84■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM243Q9BU79 118 aa15.84■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa15.84■□□□□ 0.13
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GUT8 65 aa15.83■□□□□ 0.12
SMKR1-201ENST00000462322 FAM231BA6NCW3 169 aa15.83■□□□□ 0.12
SMKR1-201ENST00000462322 RPL23P62829 140 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SMKR1-201ENST00000462322 COTL1Q14019 142 aa15.83■□□□□ 0.12
SMKR1-201ENST00000462322 ADIRFQ15847 76 aa15.83■□□□□ 0.12
SMKR1-201ENST00000462322 Q8N1X5 172 aa15.83■□□□□ 0.12
SMKR1-201ENST00000462322 V9GYV3 84 aa15.83■□□□□ 0.12
SMKR1-201ENST00000462322 ABCA13Q86UQ4 5058 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.6 ms