RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 AMN1Q8IY45 258 aa7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 RNF185Q96GF1 192 aa7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM231BA6NCW3 169 aa7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 SMKR1H3BMG3 65 aa7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 RTL8CO15255 209 aa7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 CAMPP49913 170 aa7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 NCR2O95944 276 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 IGHV3-30P01768 117 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 IGHV3-33P01772 117 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 TIRAPP58753 221 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 LELP1Q5T871 98 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 RASL11AQ6T310 242 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 BORCS7Q96B45 105 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 SEC11CQ9BY50 192 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 MT-ND4LP03901 98 aa7.46□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 RAB4AP20338 218 aa7.46□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 RIGQ13278 110 aa7.46□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.46□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.46□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GXF2 115 aa7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 NIT2Q9NQR4 276 aa7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 PPP1R2P9O14990 202 aa7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.43□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 H7C1H1 209 aa7.43□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.43□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 C6orf223Q8N319 242 aa7.43□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.43□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.43□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 APOC3P02656 99 aa7.42□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 HBBP68871 147 aa7.42□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 TNP2Q05952 138 aa7.42□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.42□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 NIT1Q86X76 327 aa7.42□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 NRACQ8N912 160 aa7.42□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A087WWC5 75 aa7.41□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 GAGE6Q13070 117 aa7.41□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 TTC32Q5I0X7 151 aa7.41□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.41□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8N976 141 aa7.41□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.41□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.41□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.4□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.4□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 MPV17L2Q567V2 206 aa7.4□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.4□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 Q9HAA7 133 aa7.4□□□□□ -1.22
RPRD1B-202ENST00000449186 D6R8Y8 96 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM262E9PQX1 116 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 MRAP2Q96G30 205 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 ST20Q9HBF5 79 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 KLK12Q9UKR0 248 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GVY2 172 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GW15 77 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TSHBP01222 138 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 NPYP01303 97 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 IQCJQ1A5X6 159 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 BTF3L4Q96K17 158 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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