RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 P0DMU3 169 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 FAM231AP0DMU4 169 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 FAM231CP0DMU5 169 aa11.14□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM223A0PJW6 202 aa11.13□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.13□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 H3BUX3 64 aa11.13□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.12□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.12□□□□□ -0.63
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TOP3B-206ENST00000436282 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.12□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 GATA3P23771 443 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 SRD5A1P18405 259 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 BLCAPP62952 87 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 RHOHQ15669 191 aa11.11□□□□□ -0.63
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TOP3B-206ENST00000436282 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.11□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.1□□□□□ -0.63
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TOP3B-206ENST00000436282 H7C2G1 150 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 ATXN8Q156A1 80 aa11.1□□□□□ -0.63
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TOP3B-206ENST00000436282 A0A0J9YX75 114 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-206ENST00000436282 LINC01600Q96MT4 127 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 POLQO75417 2590 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.08□□□□□ -0.63
TOP3B-206ENST00000436282 M0QY20 66 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 GAGE5Q13069 117 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 GAGE6Q13070 117 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01620Q4KN68 170 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf85Q96MD7 179 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 MDFICQ9P1T7 246 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 H3BUA1 57 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 M0R2P5 195 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 BRI3O95415 125 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF56Q15929 161 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 Q1RN00 199 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 Q8N1Y9 231 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 SNCGO76070 127 aa11.07□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 MSMBP08118 114 aa11.07□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.07□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.07□□□□□ -0.64
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TOP3B-206ENST00000436282 GAGE2EQ4V326 116 aa11.07□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.07□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 AVPP01185 164 aa11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 ELANEP08246 267 aa11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 ID1P41134 155 aa11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0J9YXY3 114 aa11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.06□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 CENPEQ02224 2701 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0J9YXV3 536 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 IGHG2P01859 326 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 A6NDX4 124 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.04□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.04□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.04□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 Q6Q795 121 aa11.04□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.04□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 DCANP1Q8TF63 244 aa11.04□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 I3L3M4 83 aa11.03□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TRIAP1O43715 76 aa11.03□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 CRLF1O75462 422 aa11.03□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.03□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 ODF3Q96PU9 254 aa11.03□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF580Q9UK33 172 aa11.03□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.02□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
TOP3B-206ENST00000436282 H3BMM0 161 aa11.02□□□□□ -0.65
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.02□□□□□ -0.65
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2WQ96B02 151 aa11.02□□□□□ -0.65
TOP3B-206ENST00000436282 LITAFQ99732 161 aa11.02□□□□□ -0.65
TOP3B-206ENST00000436282 LRRK2Q5S007 2527 aa11.02□□□□□ -0.65
TOP3B-206ENST00000436282 B5MCH6 92 aa11.02□□□□□ -0.65
TOP3B-206ENST00000436282 K7EMT4 169 aa11.02□□□□□ -0.65
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