RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF726P1Q15940 193 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRR4Q16378 134 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZFP69Q49AA0 526 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB24Q969Q5 203 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 DERL1Q9BUN8 251 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 PEX7O00628 323 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 H2AFB2P0C5Z0 115 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB4BP61018 213 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 IQCJQ1A5X6 159 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZRP5 223 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZFP82Q8N141 532 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 AP5S1Q9NUS5 200 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1W2PPV4 95 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 MPC2O95563 127 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEFA1P59665 94 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXI1Q12951 378 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM231BA6NCW3 169 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC160A6NGH7 325 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 CENPXA8MT69 81 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 M0QY20 66 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 GZMBP10144 247 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCL2P10415 239 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP6V0CP27449 155 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 CACNG7P62955 275 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1orf137Q5JT78 98 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 AQP10Q96PS8 301 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0U1RQV1 116 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM168BA1KXE4 195 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM74A7A6NL05 159 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 F5H697 171 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 K7EQM0 130 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNAI2O43623 268 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFNA7P01567 189 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 P01737 135 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTTG1IPP53801 180 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 CARD19Q96LW7 228 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM243Q9BU79 118 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1B0GUV1 79 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1W2PRE2 83 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 H0Y9J4 135 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPAN13O95857 204 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 LTAP01374 205 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 MT-ND6P03923 174 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 MGPP08493 103 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 AMTP48728 403 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 SULT1A2P50226 295 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFITM3Q01628 133 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAGE2BQ13066 116 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZNX1 250 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANAPC16Q96DE5 110 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 CXorf1O96002 111 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGLV7-43P04211 117 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 XCL1P47992 114 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 PKIAP61925 76 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q5BKY6 102 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCO2A0A1W2PP80 73 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCL25O15444 150 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR5AL1P0C617 328 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms