RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384109.1

RNU6-1029P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1029, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1029P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1029P-201ENST00000384109 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 C20orf197Q8N268 126 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZNF815PA8K554 130 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 J3KT08 172 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DEGS1O15121 323 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 S100GP29377 79 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 BATF3Q9NR55 127 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 V9GYQ6 96 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 A0A0D9SFI3 127 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MT-ND4LP03901 98 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SPCS2Q15005 226 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 BANF2Q9H503 90 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 J3QLW9 94 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 WFDC2Q14508 124 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TMEM244Q5VVB8 128 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 WNK3Q9BYP7 1800 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PLXNB2O15031 1838 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MYH6P13533 1939 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 M0R3E3 92 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FABP1P07148 127 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CLLU1Q5K131 121 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PRO0255Q9UI72 69 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GOLGA3Q08378 1498 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 LAMA1P25391 3075 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DDA1Q9BW61 102 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TGP01266 2768 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PDZD2O15018 2839 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MYH8P13535 1937 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 A0A1B0GX51 115 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 M0R2P5 195 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SCTP09683 121 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SPRR2EP22531 72 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SPRR2BP35325 72 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SPRR2AP35326 72 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TSTD3H0UI37 97 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TNFSF15O95150 251 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 Q5VSD8 79 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TCTE3Q8IZS6 198 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1029P-201ENST00000384109 G3V318 75 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PIN1P1O15428 100 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HSPB11Q9Y547 144 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ACACBO00763 2458 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CMPK1P30085 196 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 EDDM3BP56851 147 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NDUFA12Q9UI09 145 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HIGD1AQ9Y241 93 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GINS2Q9Y248 185 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NF1P21359 2839 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USF3Q68DE3 2245 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PRM1P04553 51 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 LINC01545Q5VT33 79 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SPANXCQ9NY87 97 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CUBNO60494 3623 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 Q5VV11 94 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ERCC6Q03468 1493 aa-0.82□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms