RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.74□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.74□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.74□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 RYR1P21817 5038 aa13.73□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.73□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.73□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.72□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13.72□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa13.71□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13.71□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 RAB5AP20339 215 aa13.71□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.71□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.71□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.71□□□□□ -0.21
PITX3-201ENST00000370002 A0A087WTM6 91 aa13.71□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 HIGD1CA8MV81 97 aa13.71□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 H3BVH4 76 aa13.71□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 CXCL1P09341 107 aa13.71□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 LINC00694P0DN24 101 aa13.71□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 LAGE3Q14657 143 aa13.7□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 ZFP82Q8N141 532 aa13.7□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 PCLOQ9Y6V0 5065 aa13.7□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.69□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 COX19Q49B96 90 aa13.69□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 Q6ZSN1 163 aa13.69□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 NUP35Q8NFH5 326 aa13.69□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 BORCS7Q96B45 105 aa13.69□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 GZMBP10144 247 aa13.68□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.68□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 GTSF1Q8WW33 167 aa13.68□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.67□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 RASL11AQ6T310 242 aa13.67□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.67□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.67□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 JPT2Q9H910 190 aa13.67□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.66□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.66□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 DNAH5Q8TE73 4624 aa13.66□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 GAGE12JA6NER3 117 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 F2Z2F3 143 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 GAGE1Q13065 139 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 GAGE4Q13068 117 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 GAGE5Q13069 117 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 GAGE13Q4V321 117 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 WDR73Q6P4I2 378 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PITX3-201ENST00000370002 A0A1B0GUT8 65 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 A0A1B0GW15 77 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 S100A8P05109 93 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 IGLC6P0CF74 106 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 CTRLP40313 264 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 RIGQ13278 110 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 Q8N1X5 172 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 TPPP3Q9BW30 176 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 HSPG2P98160 4391 aa13.63□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 M0R381 172 aa13.63□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 PSCAO43653 123 aa13.63□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 OR5AL1P0C617 328 aa13.63□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 TM2D2Q9BX73 214 aa13.63□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 SNAI2O43623 268 aa13.62□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 MT-ND6P03923 174 aa13.62□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 HBBP68871 147 aa13.62□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.62□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.62□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.62□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.61□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 A0A087WWL8 130 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 A0A1B0GXF2 115 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 RAB4BP61018 213 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 CHCHD7Q9BUK0 85 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 COX11Q9Y6N1 276 aa13.6□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 IGHV3-30P01768 117 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 IGHV3-33P01772 117 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 HLA-DQA1P01909 254 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 CACNG7P62955 275 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 CNFNQ9BYD5 112 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 Q9UF83 564 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa13.59□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa13.58□□□□□ -0.23
PITX3-201ENST00000370002 CAMPP49913 170 aa13.58□□□□□ -0.24
PITX3-201ENST00000370002 RAB5BP61020 215 aa13.58□□□□□ -0.24
PITX3-201ENST00000370002 TRGC2P03986 189 aa13.57□□□□□ -0.24
PITX3-201ENST00000370002 UBE2D3P61077 147 aa13.57□□□□□ -0.24
PITX3-201ENST00000370002 UBE2D2P62837 147 aa13.57□□□□□ -0.24
PITX3-201ENST00000370002 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.57□□□□□ -0.24
PITX3-201ENST00000370002 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.57□□□□□ -0.24
PITX3-201ENST00000370002 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms