RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 PRAC2D3DTV9 90 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C5orf67F2Z3F1 127 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 M0R2P5 195 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IFITM1P13164 125 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PIGYQ3MUY2 71 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 Q6Q795 121 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF329Q86UD4 541 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZIC4Q8N9L1 334 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PRAC1Q96KF2 57 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM133Q9H2Q1 129 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 KLK13Q9UKR3 277 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PRE2 83 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 UQCRQO14949 82 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 BGLAPP02818 100 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGHV4-34P06331 123 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SCTP09683 121 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 FGF6P10767 208 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 INSL3P51460 131 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 HSD52Q0P140 79 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF493Q6ZR52 646 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 MIR17HGQ75NE6 70 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM256Q8N2U0 113 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C14orf144Q96I85 54 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 KLK9Q9UKQ9 250 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 S4R3C0 116 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFAF8A1L188 74 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 A8MXK9 166 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C12orf77C9JDV5 145 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 LGALS9O00182 355 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CECR9P0C854 216 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PLNP26678 52 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SS18Q15532 418 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 LY6EQ16553 131 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZQT7 251 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf111Q8N326 155 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 LINC01555Q8NAE3 123 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CCL13Q99616 98 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 WFDC6Q9BQY6 131 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SDF2L1Q9HCN8 221 aa1.85□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PLA2G10O15496 165 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CRYBB3P26998 211 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 FXYD2P54710 66 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SH2D6Q7Z4S9 175 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 LEAP2Q969E1 77 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TIMM17AQ99595 171 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf88Q9BSF0 95 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TIMM21Q9BVV7 248 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 COLCA2A8K830 154 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 FABP5P3A8MUU1 101 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 OVOL1O14753 267 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 FOLR2P14207 255 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF138P52744 262 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PSG7Q13046 419 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA45Q537H7 98 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ELSPBP1Q96BH3 223 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TRGV9Q99603 122 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PSG8Q9UQ74 426 aa1.84□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GV90 55 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 C7orf66A4D0T2 115 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 TRBV12-3P01733 135 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 COX6A1P12074 109 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF56Q15929 161 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 C12orf74Q32Q52 190 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 VN1R4Q7Z5H5 301 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 LYZL4Q96KX0 146 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 CHCHD7Q9BUK0 85 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 PRNDQ9UKY0 176 aa1.84□□□□□ -2.12
CCSAP-202ENST00000366686 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms