RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 TRGC1P0CF51 173 aa10.03□□□□□ -0.8
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP10-2P60368 255 aa10.03□□□□□ -0.8
CSAG1-201ENST00000361211 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.03□□□□□ -0.8
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.03□□□□□ -0.8
CSAG1-201ENST00000361211 M0QY20 66 aa10.02□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 WDR73Q6P4I2 378 aa10.02□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 NIT1Q86X76 327 aa10.02□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.02□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 Q9HAA7 133 aa10.02□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 A8MWL6 223 aa10.01□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 TWIST1Q15672 202 aa10.01□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 CT83Q5H943 113 aa10.01□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.01□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 RYR1P21817 5038 aa10□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 C16orf90A8MZG2 172 aa10□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 PEA15Q15121 130 aa10□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 OSTCQ9NRP0 149 aa10□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 A0A087WTM6 91 aa9.99□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.99□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.99□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.99□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 ISOC2Q96AB3 205 aa9.99□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 V9GYV3 84 aa9.99□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 HSPG2P98160 4391 aa9.98□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 H7C1H1 209 aa9.98□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 LAGE3Q14657 143 aa9.98□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 ADIRFQ15847 76 aa9.98□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.98□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 RASL11AQ6T310 242 aa9.98□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 TSKUQ8WUA8 353 aa9.98□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.98□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.97□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 HIGD1CA8MV81 97 aa9.97□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 NAT8Q9UHE5 227 aa9.97□□□□□ -0.81
CSAG1-201ENST00000361211 GATD1Q8NB37 220 aa9.96□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.96□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.96□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 KLK12Q9UKR0 248 aa9.96□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.96□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 A0A087WX48 190 aa9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 PSCAO43653 123 aa9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 MPV17L2Q567V2 206 aa9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 NIT2Q9NQR4 276 aa9.95□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM262E9PQX1 116 aa9.94□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 EREGO14944 169 aa9.94□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.94□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GUT8 65 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 FAM231BA6NCW3 169 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 IFITM2Q01629 132 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 GAGE6Q13070 117 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 WFDC2Q14508 124 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 IQCJQ1A5X6 159 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 NUP35Q8NFH5 326 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 BORCS7Q96B45 105 aa9.93□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.92□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.92□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 GAS8-AS1O95177 125 aa9.92□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.92□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.92□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.92□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N976 141 aa9.92□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2WQ96B02 151 aa9.92□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 RAB14P61106 215 aa9.91□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 RNF185Q96GF1 192 aa9.91□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 TM2D2Q9BX73 214 aa9.91□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.91□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.9□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 RBX1P62877 108 aa9.9□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 ELOBQ15370 118 aa9.9□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 CLLU1Q5K131 121 aa9.9□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 ENHOQ6UWT2 76 aa9.9□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 FRZBQ92765 325 aa9.9□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.9□□□□□ -0.82
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.89□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 LECT2O14960 151 aa9.89□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.89□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 AMN1Q8IY45 258 aa9.89□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N814 137 aa9.89□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.89□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.89□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 RAB4AP20338 218 aa9.88□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 PKIAP61925 76 aa9.88□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 RIGQ13278 110 aa9.88□□□□□ -0.83
CSAG1-201ENST00000361211 COTL1Q14019 142 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.8 ms