RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 DKK2Q9UBU2 259 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 V9GYY9 64 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GX51 115 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 K7ERJ3 54 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFS5O43920 106 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 LGALS9O00182 355 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 IGLV2-23P01705 113 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 IGLV1-47P01700 117 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 SVIPQ8NHG7 77 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0B4J2C4 111 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-201ENST00000356100 IGLL5B9A064 214 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 NPSP0C0P6 89 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 SLURP1P55000 103 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 GNRH2O43555 120 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 WISP1O95388 367 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 NREPQ16612 68 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2AP49459 152 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 B9D2Q9BPU9 175 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 LYRM9A8MSI8 78 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 DIRC1Q969H9 104 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 MDFICQ9P1T7 246 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 E9PLD3 99 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 ODF3BA8MYP8 253 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 Q8N9W7 124 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0J9YXY3 114 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZQT7 251 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 PRO0255Q9UI72 69 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 TEX22C9J3V5 150 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 DEFB136Q30KP8 78 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 MUC7Q8TAX7 377 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 BAALCQ8WXS3 180 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0J9YX75 114 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 LYPD6Q86Y78 171 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0J9YY99 117 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 F8W735 103 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 PCP2Q8IVA1 136 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 SIRPDQ9H106 197 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 IGF1P05019 195 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 P0C879 139 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 MIAQ16674 131 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 C5orf47Q569G3 176 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 A0A087WW49 117 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 PROP1O75360 226 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 SPAG11BQ08648 103 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 GTSF1Q8WW33 167 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 AMTNQ6UX39 209 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 C17orf77Q96MU5 243 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 COX7BP24311 80 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 A0A096LPF7 62 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF524Q96C55 264 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 WIPF3A6NGB9 483 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 PATE2Q6UY27 113 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 Q9HAA7 133 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 PSMB8P28062 276 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 TRBV12-3P01733 135 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 ODF1Q14990 250 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0J9YXV3 536 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 ADORA2A-AS1P86434 159 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 ACANP16112 2415 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-201ENST00000356100 C5orf38Q86SI9 138 aa4.6□□□□□ -1.67
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