RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 TMEM97Q5BJF2 176 aa16.69■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 OR11H12B2RN74 326 aa16.68■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 STHQ8IWL8 128 aa16.68■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 JMJD8Q96S16 334 aa16.68■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.68■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 COX11Q9Y6N1 276 aa16.68■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 GAGE1Q13065 139 aa16.68■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 XCL2Q9UBD3 114 aa16.68■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa16.67■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 PRSS29PA6NIE9 313 aa16.67■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 IGIPA6NJ69 53 aa16.67■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 NDUFA7O95182 113 aa16.67■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 TSHBP01222 138 aa16.67■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 RIPPLY3P57055 190 aa16.67■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 C11orf72Q8NBR9 251 aa16.67■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.66■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 LINC01549A6NIU2 74 aa16.66■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 SAP30O75446 220 aa16.66■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 PROK1P58294 105 aa16.66■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 ORAOV1Q8WV07 137 aa16.66■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 LY6G6DO95868 133 aa16.65■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 A8MWV9 139 aa16.65■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 NPSP0C0P6 89 aa16.65■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa16.65■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 UFSP1Q6NVU6 142 aa16.65■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 HIVEP2P31629 2446 aa16.64■□□□□ 0.26
SNX18-201ENST00000326277 TAX1BP3O14907 124 aa16.64■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16.64■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 HSD52Q0P140 79 aa16.63■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 PTH2Q96A98 100 aa16.63■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 EDA2RQ9HAV5 297 aa16.63■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.63■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 I3L3M4 83 aa16.62■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 P0DMU3 169 aa16.62■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 FAM231AP0DMU4 169 aa16.62■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 FAM231CP0DMU5 169 aa16.62■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 TMEM141Q96I45 108 aa16.62■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 TIMM17AQ99595 171 aa16.62■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 RHOHQ15669 191 aa16.61■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 CFAP126Q5VTH2 177 aa16.61■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.61■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 AZU1P20160 251 aa16.61■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 SEC11AP67812 179 aa16.61■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa16.61■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa16.6■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 SPXQ9BT56 116 aa16.6■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.6■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.6■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 IGLV1-51P01701 117 aa16.6■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 PMVKQ15126 192 aa16.6■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 Q6ZSN1 163 aa16.6■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 HIGD1BQ9P298 99 aa16.6■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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SNX18-201ENST00000326277 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.58■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 CST9LQ9H4G1 147 aa16.58■□□□□ 0.25
SNX18-201ENST00000326277 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa16.57■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP10-3P60369 221 aa16.57■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.57■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 CHAC1Q9BUX1 264 aa16.57■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 Q9UF83 564 aa16.57■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 OTOGQ6ZRI0 2925 aa16.57■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 EMP1P54849 157 aa16.56■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 WFDC10AQ9H1F0 79 aa16.56■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 NOTCH2Q04721 2471 aa16.55■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 C11orf86A6NJI1 115 aa16.55■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 OR11H2Q8NH07 326 aa16.55■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa16.55■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 RHODO00212 210 aa16.54■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 RS1O15537 224 aa16.54■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 C19orf73Q9NVV2 129 aa16.54■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 A6NDN8 102 aa16.54■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 E9PLD3 99 aa16.54■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 IL17DQ8TAD2 202 aa16.54■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 FAM110AQ9BQ89 295 aa16.52■□□□□ 0.24
SNX18-201ENST00000326277 IGHV3-53P01767 116 aa16.52■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa16.52■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 NDUFA11Q86Y39 141 aa16.52■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 PRADC1Q9BSG0 188 aa16.52■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 INAFM1C9JVW0 142 aa16.51■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 UBE2V1Q13404 147 aa16.51■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 VAMP3Q15836 100 aa16.51■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 CCL25O15444 150 aa16.5■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 GCSHP23434 173 aa16.5■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 JMJD1CQ15652 2540 aa16.5■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa16.5■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa16.49■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 PTTG1IPP53801 180 aa16.49■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.49■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 FXYD2P54710 66 aa16.49■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 H3BRM9 83 aa16.48■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 K7EP13 123 aa16.48■□□□□ 0.23
SNX18-201ENST00000326277 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
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