RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	XCL1	P47992	114 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNAP23-223	ENST00000627440	GNG2	P59768	71 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNAP23-223	ENST00000627440	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNAP23-223	ENST00000627440	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNAP23-223	ENST00000627440	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SNAP23-223	ENST00000627440	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNAP23-223	ENST00000627440	ARV1	Q9H2C2	271 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNAP23-223	ENST00000627440	SAR1A	Q9NR31	198 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	CDS2	O95674	445 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	LIMS3	P0CW19	117 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	LIMS4	P0CW20	117 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	CDNF	Q49AH0	187 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	NPS	P0C0P6	89 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	HSMCR30	P0CW71	290 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	RANBP1	P43487	201 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	PLP1	P60201	277 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	AARD	Q4LEZ3	155 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	AHSA2	Q719I0	299 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL6	Q9H0F7	186 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440		L7N2F9	121 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	COX7A2P2	O60397	106 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	SCGB1D2	O95969	90 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	VAMP2	P63027	116 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	AKR1C1	Q04828	323 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	C22orf24	Q9Y442	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	FNDC10	F2Z333	226 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2L6	O14933	153 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	SSX5	O60225	188 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	CTRL	P40313	264 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	PATE2	Q6UY27	113 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM243	Q9BU79	118 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R036	132 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL25	O15444	150 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	GYG2	O15488	501 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	TCRA	P04437	139 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	NTF3	P20783	257 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB11A	P62491	216 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB32	Q13637	225 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	MED28	Q9H204	178 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	IL36B	Q9NZH7	164 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0B4J2A0	478 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	SELENOT	P62341	195 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	PRLH	P81277	87 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	HOGA1	Q86XE5	327 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	GFI1	Q99684	422 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS46	E5RG02	174 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440		F6UZH7	168 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	WRB	O00258	174 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	BTF3L4	Q96K17	158 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	DUSP21	Q9H596	190 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SNAP23-223	ENST00000627440	SMCO3	A2RU48	225 aa		2.75	□□□□□ -1.97

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