RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608657.5

ITGB5-212, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-212ENST00000608657 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 VGLL1Q99990 258 aa6.52□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 GAGE1Q13065 139 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 ERCC8Q13216 396 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 LINC01545Q5VT33 79 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 MRAP2Q96G30 205 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.51□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 B9D2Q9BPU9 175 aa6.51□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 EREGO14944 169 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 ATP5LO75964 103 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 TSPOP30536 169 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 LEPP41159 167 aa6.5□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.5□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 LINC01546A6NGU7 62 aa6.49□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 CDKN1BP46527 198 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.49□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 XCL2Q9UBD3 114 aa6.49□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.49□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 J3KRW8 73 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 INSP01308 110 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 FCER1GP30273 86 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 BATFQ16520 125 aa6.48□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 SPATA25Q9BR10 227 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 ZMAT4Q9H898 229 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 FBN3Q75N90 2809 aa6.48□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.47□□□□□ -1.37
ITGB5-212ENST00000608657 M0R381 172 aa6.47□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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ITGB5-212ENST00000608657 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 SMIM17P0DL12 118 aa6.46□□□□□ -1.38
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ITGB5-212ENST00000608657 C20orf78Q9BR46 151 aa6.46□□□□□ -1.38
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ITGB5-212ENST00000608657 RETNQ9HD89 108 aa6.46□□□□□ -1.38
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ITGB5-212ENST00000608657 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.46□□□□□ -1.38
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ITGB5-212ENST00000608657 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 C7orf71A4D174 169 aa6.45□□□□□ -1.38
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ITGB5-212ENST00000608657 NPYP01303 97 aa6.45□□□□□ -1.38
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ITGB5-212ENST00000608657 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 SEC11AP67812 179 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 LAGE3Q14657 143 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 KIR3DS1Q14943 382 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 SYT8Q8NBV8 401 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.45□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 H0Y8G0 127 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 PRR9Q5T870 116 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.44□□□□□ -1.38
ITGB5-212ENST00000608657 OR11H2Q8NH07 326 aa6.44□□□□□ -1.38
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