RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF727A8MUV8 499 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 SNAI2O43623 268 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 CRYGDP07320 174 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 CXCL1P09341 107 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5AL1P0C617 328 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 MED14OSP0DP75 135 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 Q9UF83 564 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 XKRY2A2RUG3 117 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE12JA6NER3 117 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 C9JQL5 133 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 F5H697 171 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 SIVA1O15304 175 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 NXPH4O95158 308 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 ERVFC1-1P60608 527 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE1Q13065 139 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE4Q13068 117 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE5Q13069 117 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 PEA15Q15121 130 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 RHOHQ15669 191 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE13Q4V321 117 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZR54 194 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 F2Z2F3 143 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 RHODO00212 210 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLC6P0CF74 106 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM17P0DL12 118 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 NTF3P20783 257 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB14P61106 215 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF56Q15929 161 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 UPK3BQ9BT76 320 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PPQ1 181 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MWL6 223 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 RTL8CO15255 209 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 MGPP08493 103 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB4BP61018 213 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 CACNG7P62955 275 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TWIST1Q15672 202 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE1DQ5T752 114 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01551Q86U37 167 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 EVI2AP22794 236 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 IFITM2Q01629 132 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR73Q6P4I2 378 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 C6orf223Q8N319 242 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 GTSF1Q8WW33 167 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 OSTCQ9NRP0 149 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 NAT8Q9UHE5 227 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 RYR3Q15413 4870 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3-30P01768 117 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3-33P01772 117 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TRGC1P0CF51 173 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 TIRAPP58753 221 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00315P59091 139 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-211ENST00000588374 ADIRFQ15847 76 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms