RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 F2Z2F3 143 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 SMIM17P0DL12 118 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 PMCHP20382 165 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 SEC11AP67812 179 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 RIGQ13278 110 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 STHQ8IWL8 128 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 CNFNQ9BYD5 112 aa6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 VWFP04275 2813 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 TAX1BP3O14907 124 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 HSBP1O75506 76 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 CD7P09564 240 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.51□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR5AL1P0C617 328 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 ASIPP42127 132 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 MUC21Q5SSG8 566 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 AGRNO00468 2067 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.5□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-211ENST00000586397 WIPF1O43516 503 aa6.5□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-211ENST00000586397 MED14OSP0DP75 135 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 GATD1Q8NB37 220 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 G3V4G9 280 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGLL1P15814 213 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 SRIP30626 198 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 FXYD7P58549 80 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 AP1S3Q96PC3 154 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 H3BVH4 76 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 INSP01308 110 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 CACNG7P62955 275 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.48□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-211ENST00000586397 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.48□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-211ENST00000586397 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 NTF3P20783 257 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 TWIST1Q15672 202 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 MPV17L2Q567V2 206 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 MTURNQ8N3F0 131 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.48□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.47□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.47□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 A6NDN8 102 aa6.47□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 GNRH2O43555 120 aa6.47□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 NUDT3O95989 172 aa6.47□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.47□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 RCHY1Q96PM5 261 aa6.47□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.46□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.46□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 Q8N1Y9 231 aa6.46□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.46□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.46□□□□□ -1.37
PRKAR1A-211ENST00000586397 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 J3QR89 54 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 XCL2Q9UBD3 114 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 STAB1Q9NY15 2570 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 H3BRM9 83 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 NXPH4O95158 308 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRR31Q5SQ13 230 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 C9orf85Q96MD7 179 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKAR1A-211ENST00000586397 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.45□□□□□ -1.38
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