RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	HSBP1	O75506	76 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLV1-51	P01701	117 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	TYMS	P04818	313 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	CXCL1	P09341	107 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	CRISP2	P16562	243 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	TSPO	P30536	169 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	PRR4	Q16378	134 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	PSMG4	Q5JS54	123 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	RASL11A	Q6T310	242 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	TSKU	Q8WUA8	353 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139		V9GYV3	84 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	MTOR	P42345	2549 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A0J9YX75	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A1B0GW15	77 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	COLCA2	A8K830	154 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139		A8MTW9	85 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	MT-ND6	P03923	174 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	S100A8	P05109	93 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF688	P0C7X2	276 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB5A	P20339	215 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	HLA-DMB	P28068	263 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	BORCS7	Q96B45	105 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM210B	Q96KR6	192 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	YPEL4	Q96NS1	127 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	VGLL1	Q99990	258 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CNOT1-222	ENST00000570139	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	HLA-DRB4	P13762	266 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	CXCL6	P80162	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139		Q8TAT8	98 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM189	A5PLL7	270 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	KLLN	B2CW77	178 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	OR11H12	B2RN74	326 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	SIVA1	O15304	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	SH2D1A	O60880	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	GPX1	P07203	203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB5B	P61020	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	ERCC8	Q13216	396 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	RASL10A	Q92737	203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	KCNS1	Q96KK3	526 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A0J9YWU9	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	LYRM9	A8MSI8	78 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	HIGD1C	A8MV81	97 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139		F2Z2F3	143 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB131A	P59861	70 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	SLA	Q13239	276 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	C3orf56	Q8N813	242 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	F8	P00451	2351 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139		H3BMM0	161 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	ORM1	P02763	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	PMCH	P20382	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	CTRL	P40313	264 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	CRIP1	P50238	77 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	HBB	P68871	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.7 ms