RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528439.5

RPS3-210, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 473 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-210ENST00000528439 U3KQK5 164 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 NACAE9PAV3 2078 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 D6R8Y8 96 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 UBE2CO00762 179 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 CRYGDP07320 174 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 Q6ZTI0 123 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 PTH2Q96A98 100 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 RNF183Q96D59 192 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 SPXQ9BT56 116 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 NPYP01303 97 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 MGPP08493 103 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 Q6ZWC4 215 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 Q8NAQ8 132 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 OR11H2Q8NH07 326 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 DEFB4AO15263 64 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 EMP1P54849 157 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 NDUFA6P56556 154 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 NRACQ8N912 160 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 RASL10AQ92737 203 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 RS1O15537 224 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 NUPR1O60356 82 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 DEFA6Q01524 100 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 ORMDL3Q8N138 153 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 PRELID3AQ96N28 172 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 GAGE12BA1L429 117 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 C5orf52A6NGY3 159 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 GAGE7O76087 117 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 GAGE12FP0CL80 117 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 GAGE12GP0CL81 117 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 GAGE12IP0CL82 117 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 CKS2P33552 79 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 Q0VG73 95 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 ZNF56Q15929 161 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 Q6ZSN1 163 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 MRAP2Q96G30 205 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 CELA1Q9UNI1 258 aa7.15□□□□□ -1.26
RPS3-210ENST00000528439 IFITM10A6NMD0 228 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 A8MWV9 139 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 SERF1AO75920 110 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 TNFRSF6BO95407 300 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 IGHV3-53P01767 116 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 PPBPP02775 128 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 SMIM17P0DL12 118 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 MIFP14174 115 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 ZNF479Q96JC4 524 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 TENM3Q9P273 2699 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 M0QY20 66 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 S100A6P06703 90 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 P0DMU3 169 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 FAM231AP0DMU4 169 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 FAM231CP0DMU5 169 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 MRAPQ8TCY5 172 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 Q9UF83 564 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 FBN3Q75N90 2809 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 F5H697 171 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 RHODO00212 210 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 HOXA5P20719 270 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 BAGE3Q86Y29 109 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 DKK2Q9UBU2 259 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 LYRM9A8MSI8 78 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 DEFB130BP0DP73 79 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-210ENST00000528439 DEFB130AP0DP74 79 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms